Не только пцр. какие бывают тесты на коронавирус и чем они отличаются

Что означает результат RT-PCR теста

Положительный результат теста PCR-RT указывает на высокую вероятность активной инфекции COVID-19 и подозрение, что пациент может заразить других. Результат не указывает, когда произошла инфекция или каковы будут симптомы.

Отрицательный результат теста PCR-RT означает, что во время теста испытуемый, вероятно, не был инфицирован. Однако заражение может произойти позже. 

Если появляются респираторные симптомы, отрицательный результат может указывать на другое клиническое состояние (например, грипп). Также возможно, что количество вируса SARS-CoV-2 в образце недостаточно для его обнаружения. Это может быть связано с неправильным отбором проб или заражением, которое слишком рано для обнаружения вируса.

Какие образцы берут для тестирования

• Молекулярный тест: для выявления текущей инфекции собираются мазки из носоглотки, носа и / или горла. Иногда берется образец слюны.
• Анализ на антитела: образец крови, взятый из вены или пальца.

Чтобы получить достоверные результаты, необходимо правильно собрать образцы:

ОТ-ПЦР-тестирование: предпочтительный образец – носоглоточный мазок

Чтобы взять образец, пациент откидывает голову назад, и человек, выполняющий процедуру, осторожно вставляет тампон в одну ноздрю до тех пор, пока не почувствует сопротивление (около 5 см). Затем, подождав несколько секунд, забирает материал, протирая тампоном слизистые

Обследование не болезненное, но может быть неприятным, поскольку вызывает слезотечение и кратковременный кашель. Если невозможно собрать материал из носоглотки, рекомендации CDC позволяют проводить тесты на других образцах, взятых из дыхательной системы – мазках из задней части горла или из ноздри. Иногда оба образца берутся одновременно, чтобы увеличить вероятность получения достаточного количества вируса. Оба образца могут быть помещены в один транспортный бокс.
Анализы на антитела: кровь, взятая из вены на руке или несколько капель крови из пальца.

Подготовка к тесту не нужна.

Тесты на коронавирус Covid-19

Не пить, не курить, резинку не жевать

— Многие ученые утверждают, что результаты тестов на COVID-19 достоверны от 60 до 95% случаев. Однако на результат могут повлиять очень много различных факторов: как действия человека перед забором материала, так и манипуляции специалиста, который этот забор проводит, — предупреждает Менделевич.

Причин, по которым ПЦР-тесты дают недостоверные результаты, по мнению собеседника «Реального времени», две: неправильный забор биоматериала и забор биоматериала у человека, которого не предупредили, как правильно готовиться к сдаче теста:

— Медработнику необходимо соблюдать четкий алгоритм действий, — говорит Менделевич. — По рекомендациям Минздрава, врач должен взять мазок из ротоглотки и носоглотки. При взятии мазка важна стерильность пробирок и зондов, а медработник обязательно должен быть в перчатках. Чтобы правильно взять мазок из горла, нужно, не касаясь щек и языка, провести зондом по его задней стенке. При взятии проб из носа зонд вводят в ноздрю на 2—3 см. А тот, кто сдает тест, должен понимать, что от его действий или бездействия, а также правильной подготовки зависят итоги забора. К примеру, эксперты рекомендуют в течение трех часов непосредственно перед сдачей анализа не есть, не пить, не курить, не чистить зубы и не полоскать рот. Также следует воздержаться от использования жевательной резинки. Мазок из носа будет неинформативным, если пациент до этого высморкался или промыл нос, если мазок был взят при неглубоком вводе в носовые ходы.

Принять решение

Далеко не всегда есть необходимость ориентироваться на ПЦР-тесты. Гораздо важнее оценка клинической картины, сообщил «Известиям» профессор-исследователь Балтийского федерального университета имени Канта Андрей Продеус.

— Глобально эта статья важна в том, что впервые для России это было доказано клинически на большой выборке пациентов. Нужно понимать: если тест позитивен, это говорит о наличии патогена, но если он негативен, это не означает, что вируса в организме нет. Поэтому ориентироваться на клинические признаки, такие как одышка, температура и кашель, важнее, — пояснил он.

Неопознанный COVID

Фото: РИА Новости/Антон Вергун

Более того, во время пандемии вклад других заболеваний, вызывающих вирусную пневмонию и дающих картину «матового стекла» на КТ, весьма ограничен, сообщил в разговоре с «Известиями» директор научно-клинического центра прецизионной и регенеративной медицины Казанского федерального университета (вуза — участника проекта «5-100») Альберт Ризванов.

— Логично предположить, что большинство пациентов, независимо от результатов тестирования, но демонстрирующих типичную клиническую картину, страдают именно COVID-19. Поэтому результаты исследования вполне логичны, — подчеркнул специалист

— Безусловно, важно, что в России проводятся такие качественные широкомасштабные исследования, которые в целом очень полезны как для наших врачей, так и для зарубежных коллег

Ранее главный внештатный пульмонолог Минздрава России Сергей Авдеев заявил СМИ, что примерно в 30–40% случаев тест на коронавирус может дать ложноотрицательный результат. По его словам, это не связано с качеством самих тестов. Он подчеркнул, что чувствительность и специфичность тест-систем не подвергается никакому сомнению, а проблема заключается в некачественном взятии биоматериалов.

Неопознанный COVID

Фото: ТАСС/Артем Геодакян

Что же касается новых полученных клинических данных, «Известия» направили запрос в Минздрав РФ с вопросом о том, будут ли они как-то приняты во внимание, однако получить ответ на момент публикации не удалось. В Роспотребнадзоре редакции сообщили, что причины ошибок тестов могут быть разные: наличие «похожего» по структуре, родственного возбудителя, слишком малое его количество и так далее

— Нарушения при подготовке пациента чаще всего приводят к ложноотрицательным результатам. Например, при взятии мазка на коронавирус пациент должен не менее трех часов ничего не есть и не пить, не полоскать горло. При несоблюдении этих правил можно просто «смыть» вирус и результат будет отрицательным, — сообщили в ведомстве. — Нарушение технологии выполнения анализа встречается сейчас очень редко, чаще всего это «человеческий фактор»: случайно перепутали пробу, отвлеклись и ввели результат не в ту ячейку и т.д. Во всех лабораториях ведется специальный внутрилабораторный контроль качества, который позволяет выловить такие ошибки до выдачи результата.

В исследовании Сеченовского университета сказано, что полученные результаты аналогичны данным по США, где от 42 до 51,8% людей получают ложноотрицательный результат теста ПЦР

В целом же уровень таких результатов колеблется от 20 до 66% — в зависимости от давности появления симптомов, поэтому результаты должны быть интерпретированы с осторожностью

Неопознанный COVID

Фото: ТАСС/Антон Новодережкин

Помимо российских ученых, в исследовании приняли участие сотрудники Имперского колледжа Лондона, Пизанского университета, Университета Отто фон Герике в Магдебурге и Оксфордского университета.

Достоинства и недостатки метода

Тест на антитела позволяет узнать стадию заболевания, а также предположить тяжесть его течения. В ряде случаев он помогает выявить людей, перенесших коронавирус бессимптомно и выработавших иммунитет. Тест дает результаты за 10-15 минут.

Тесты могут давать ложноотрицательный результат, так как известны еще не все антитела к коронавирусу. Кроме того, антитела появляются в крови не сразу, и тест, проведенный на следующий день после инфицирования, может не дать результатов. Не исключен и ложноположительный результат — тест может среагировать на антигены вирусов, вызывающих обычную простуду.

Сдавать тест на антитела имеет смысл, если появились первые симптомы заболевания. Если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом. Также если есть подозрение, что заболевание перенесено бессимптомно, и пациент хочет быть уверенным, что у него выработан иммунитет.

Смотрите далее: Лечения нет. Что не так в борьбе медиков с COVID-19

Метод определения иммуноглобулинов

Другое название — тест на антитела. В качестве материала для исследования берется кровь. В ней стандартным способом определяют иммуноглобулины: IgG и IgM. Подобный анализ назначают для диагностики аутоиммунных заболеваний, заболеваний системы кроветворения, пищеварительной системы и во многих других ситуациях.

Иммуноглобулины М (IgM) первыми вырабатываются в ответ на вирусную атаку, это так называемые «иммуноглобулины тревоги». Их наличие в крови говорит об острой фазе заболевания.

Иммуноглобулины G (IgG) появляются в крови в среднем спустя 5 дней после иммуноглобулинов М. Если они обнаруживаются в крови, то это может говорить о том, что заболевание прошло острую фазу либо уже перенесено, организм справился с инфекцией и даже выработал иммунитет.

Тест перед прилетом.

Помимо того, что делается тест на ковид после заграницы, некоторым категориям граждан необходимо сделать диагностику перед вылетом.

На рейсах из Турции в Россию могут прилететь иностранцы, имеющие вид на жительство на территории РФ. Авиаперевозчик запретит посадку на борт таким гражданам, если они не имеют результатов отрицательного теста на covid-19.

В связи с этим диагностическое исследование понадобится пройти непосредственно в стране нахождение.

При этом результаты не должны быть получены более, чем 72 часа назад. Тест можно сдать в любой аккредитованной клинике Турции (гражданам РФ не требуется).

Их результаты размещаются на специальном сайте. При этом вход на ресурс отличается для турецких граждан и резидентов других государств. Стоимость теста составляет не более 250 лир, что строго регулируется властями страны.

Результаты теста появятся на сайте в течение 5-24 часов после исследования. Тем, кого не устраивает этот вариант, можно пройти ПЦР-диагностику непосредственно в крупных аэропортах.

Она проводится по экспресс-методике. К недостаткам использования центров в аэропортах относят то, что придется выстоять очередь.

Список литературы

1. Всемирная организация здравоохранения. Вспышка коронавирусной инфекции COVID-19. . Дата обращения: 27.03.2020. ссылка

2. Al-Tawfiq J. A., Memish Z. A. Update on therapeutic options for Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) // Expert review of anti-infective therapy. — 2017. — № 3. — P. 269-275.ссылка

3. Centers for Disease Control and Prevention. Coronavirus (COVID-19). . Дата обращения: 27.03.2020.ссылка

4. Junqiang L., et al. CT Imaging of the 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) Pneumonia // Radiology. — 2020. — № 1. — P. 18.

5. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. О новой коронавирусной инфекции. . Дата обращения: 27.03.2020.

6. European Centre for Disease Prevention and Control. COVID-19. . Дата обращения: 27.03.2020.

7. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Taxonomy. . Дата обращения: 27.03.2020.

8. The Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins. Coronavirus COVID-19 Global Cases. . Дата обращения: 13.04.2020.

9. Руководство по инфекционным болезням / Под ред. Ю. В. Лобзина. — СПб, 2000. — Ч. 2. — С. 14-15.

10. The president’s coronavirus guidelines for America. 15 days to slow. the spread. . Дата обращения: 27.03.2020.

11. Давыдов Д., Кашубина О. Самые важные вопросы про коронавирус // Т — Ж. — 2020.

12. Shi J., Wen Z., Zhong G., Yang H., et al. Susceptibility of ferrets, cats, dogs, and other domesticated animals to SARS–coronavirus 2 // Science. — 2020.ссылка

13. ВОЗ не рекомендует применять ремдесивир у пациентов с COVID-19 // ВОЗ, 20 ноября, 2020. ссылка

14. Ivermectin // NIH, August 27, 2020.

15. Antithrombotic Therapy in Patients with COVID-19 // NIH, May 12, 2020.

16. Considerations for Certain Concomitant Medications in Patients with COVID-19 // NIH, July 30, 2020.

17. Barnaby Young, Thuan Tong Tan, Yee Sin Leo. The place for remdesivir in COVID-19 treatment // The Lancet, November 26, 2020.

Анализы на COVID-19

Обычно первые симптомы COVID-19 не отличаются от обычной простуды или инфекции верхних дыхательных путей, поэтому для определения текущей или прошлой болезни необходимы тесты.

• Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Большинство тестов на наличие активной инфекции SARS-CoV-2 основаны на методе ОТ-ПЦР, который позволяет обнаруживать вирусную РНК в образце, взятом из дыхательной системы пациента. ПЦР – это лабораторный метод, используемый для получения нескольких копий коротких фрагментов ДНК из очень маленького образца ДНК, чтобы их можно было обнаружить. Этот процесс называется амплификацией. Этап обратной транскрипции позволяет вирусной РНК превращаться в ДНК, чтобы затем можно было использовать метод ПЦР.
• Анализ крови на антитела (общий, IgG, IgM) против SARS-CoV-2 (серологический тест). Обнаружено присутствие антител, продуцируемых иммунной системой организма в ответ на SARS-CoV-2. Серологические тесты на COVID-19 позволяют подтвердить предыдущую инфекцию, однако тест на антитела не является предпочтительным методом выявления активной инфекции. Антитела появляются не раньше, чем через 1-2 недели после заражения, поэтому их нельзя обнаружить на ранних стадиях заболевания. 

Также были разработаны экспресс-тесты на наличие антител. Тестируется кровь из пальца. 

When should you get tested?

• If you are older than 6 years and have COVID-19-related symptoms
• If you came into contact with someone who has the coronavirus.
• you have been abroad for more than 48 hours and you receive a text message after completing the Passenger Locator Form (PLF).

Procedure if you are feeling ill

Do you have any of the following symptoms? Stay home and contact your GP, even if your symptoms are mild.

• Cough
• Respiratory problems
• Fever
• Aches and pains
• Fatigue
• Loss of sense of smell or taste
• Diarrhoea

If the GP suspects that you have Covid-19, they will test you or refer you to the local triage centre. The test will be sent to the lab for analysis that same day. This applies to everyone from the age of 6

While you wait for the results:

• Stay at home.
• . This list will only be used if your test is positive, as part of the contact follow-up.
• Are the people living with you feeling ill too? Then they must quarantine and get tested.
• The people living with you do not feel ill? They do not have to go into quarantine. They must, however, be extra vigilant and follow the golden rules.

You always get the result of your test, regardless of whether it is positive or negative.

Is the test positive?

• Isolate yourself. Stay at home for at least 7 days.
• Follow the advice of your GP’s advice.
• Only leave your house after 7 days
  • If you have not had a fever for at least 3 days
  • If you no longer have respiratory problems (shortness of breath, problems with breathing).
• Contact tracing will start. The people you live with or came into close contact with must quarantine.

If you came into contact with someone who has the coronavirus:

• You will receive a phone call or a text message from contact tracing.
• Stay at home. Go into quarantine for 7 days. The quarantine period starts when you last had contact with the person who has coronavirus.
• Get tested seven days after your encounter with a high-risk contact.
• Did you test negative? You no longer need to quarantine. Stay alert for another 7 days.
• Did you test positive? Isolate yourself. Stay at home for at least 7 more days. Read more about what to do here.
• Do you feel ill ? Contact your GP.

If you return from abroad

• Fill in the Passenger Locator Form within 48 hours before your arrival in Belgium.
  • Did you receive a text message ? You have a high risk of COVID-19. You have to quarantine. This is compulsory if you come from a red zone.You do not have to be tested.
  • Did you not receive a text message ? You don’t have to be quarantined.
• Stay at home for 7 days. The quarantine period starts from the last day you were abroad.
• Get tested seven days after the day you return home from abroad.
• Did you test negative? You no longer need to quarantine. Stay alert for another 7 days.
• Did you test positive? Isolate yourself. Stay at home for at least 7 more days. Read more about what to do here.

Подготовка к диагностике

Для получения достоверных результатов важно соблюдать правила подготовки к забору биоматериала. Перед мазком из зева и носа нельзя кушать, чистить зубы, курить и жевать резинку в течение 2 часов, на протяжении последних 30 минут не пить воду

Также на протяжении последних 2 часов рекомендуют не использовать капли/спреи в нос, горло. Если наблюдается большое количество вязкого секрета, то перед проведением мазка нужно высморкаться.

Забор венозной крови проводят утром натощак либо не ранее, чем через 6-8 часов с момента последнего приема пищи. Пить воду на протяжении этого времени можно. Если пациент принимал в течение 2 последних недель препараты, влияющие на состояние иммунной системы (Амиксин, Тилорон-С3), необходимо сообщить об этом лаборанту. Тот сделает соответствующие пометки на бланке анализа.

Характеристики и структура SARS-CoV-2

Вирион коронавируса SARS-CoV-2, как и большинство других Coronaviridae имеет шарообразную форму, с нуклеокапсидом и РНК внутри, а снаружи покрытым жировой (липидной) оболочкой. Длина РНК составляет до 30 000 нуклеотидов в последовательности, где также присутствуют нетранслируемые участки длиной 281 и 325 нуклеотида. Из липидной оболочки выступают булавовидные пепломеры гликопротеин S, гемагглютинин-эстераза (НЕ), белки М, Е.

Устойчивость во внешней среде

Согласно исследованиям2 итальянских ученых Filippo Ansaldi, P Morelli и прочих, капсид коронавируса (SARS-CoV), как и вируса группы А (Influenza A virus) повреждается при контакте с этанолом (70%), хлоргексидином (1%), гипохлоритом натрия (0,01%), что препятствует его дальнейшей репликации.

Другие дезинфекторы, которые убивают коронавирус в течение 1 минуты — этанол (80% и более), изопропанол (45%), н-пропанол (30%), мезетрония этилсульфат (0,2%).

Вирус разрушается на поверхности в случае воздействия на него температуры +33 °С в течение 16 часов, или +56 °С, в течение 10 минут.

Также инфекция разрушается при воздействии ультрафиолетовых лучей в течение 2-15 минут, это в случае обработки поверхности УФ-облучением от кварцевых ламп.

В воде коронавирусы способны сохранять свою активность в течение 9 суток. Столько же времени инфекция живет при комнатной температуре (около 22 °С) на следующих поверхностях — пластик, металл, стекло, бумага.

При охлаждении до +4 °С, особенно на фоне высокой влажности или замораживании температурой в −70 °С — в течение нескольких лет.

Тромбы повсюду…

Мы выяснили, что коронавирус повреждает не только легкие, но и эндотелий сосудов, т.к. в нем есть рецепторы, с которыми он соединяется.

Любое повреждение сосудов – сигнал для системы свертывания крови активизироваться, чтобы «залатать» эти повреждения и не допустить кровотечения.

К местам повреждений срочно сбегаются тромбоциты и встают «плечом к плечу», т.е. склеиваются. Говоря медицинским языком, происходит агрегация тромбоцитов.

Поскольку при Covid-19 повреждения сосудов множественные, то и тромбов образуется множество. Сосудистую стенку они «залатали», но при этом заблокировали кровоток, а значит, нарушили питание органа, к которому по этому сосуду доставляется все необходимое для его нормального функционирования.

В итоге – «смерть» части органа (инфаркт или инсульт) и высокая вероятность смерти больного.

Вот почему при тяжелом течении коронавирусной инфекции или при наличии факторов риска обязательно назначаются антикоагулянты или антиагреганты.

Этим же объясняется и более высокая заболеваемость и смертность у больных с сердечно-сосудистыми заболеваниями или сахарным диабетом. У них уже имеются повреждения сосудов, кровоток и так нарушен тромбами или холестериновыми бляшками, а коронавирус только усиливает эти нарушения.

Почему ПЦР-тест пока не спас мир

В настоящее время ПЦР-тесты остаются самыми чувствительными к коронавирусу. В Южной Корее и Новой Зеландии их широкое применение помогло подавить инфекцию, указывает автор публикации в Nature. Однако этот успех не удалось повторить в других странах. Согласно той же статье, в США не удалось добиться их эффективного использования из-за плохой координации, партий некачественных тестов и сложностей с поставками.

Оперативность ПЦР-теста невелика, в лучшем случае он займет несколько часов, в реальной жизни в случае плохого сценария результаты можно ожидать несколько дней. Гипотетически, человек, у которого реакция ПЦР не обнаружила коронавирус, может быть уже инфицированным на момент получения результата анализа. Проведение анализа требует специальной лаборатории и обученных специалистов, то есть, он ресурсоёмкий.

Затрудняет массовое тестирование и сравнительно высокая цена теста. В Москве его проведение на дому может стоить более 5000 рублей.