Coronavirus (covid-19) mortality rate

Sources

1. Symptoms of Novel Coronavirus (2019-nCoV) — United States Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
2. Clinical Characteristics of 138 Hospitalized Patients With 2019 Novel Coronavirus–Infected Pneumonia in Wuhan, China — JAMA, Wang et al., February 7, 2020
3. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China — Huang et al., The Lancet. January 24, 2020
4. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study — Chen et al, The Lancet, January 30, 2020
5. Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) — World Health Organization, Feb. 28, 2020

WHO Risk Assessment

International Public Health Emergency

On January 30, the World Health Organization declared the coronavirus outbreak a Global Public Health Emergency. The WHO emergency committee had convened twice [][] (on January 22 and January 23) and had declined to make such a declaration for the novel coronavirus.

After about a week, at its third meeting, the WHO has declared the outbreak a Public Health Emergency of International Concern (PHEIC).

A PHEIC is defined as “an extraordinary event which is determined to constitute a public health risk to other States through the international spread of disease and to potentially require a coordinated international response”. This definition implies a situation that is:

• serious, sudden, unusual or unexpected;
• carries implications for public health beyond the affected State’s national border;
• may require immediate international action.

WHO Timeline related to the Wuhan Coronavirus

• Jan. 30 WHO declares the coronavirus outbreak a Global Public Health Emergency after holding its third Emergency Committee. It recommends that the interim name of the disease causing the current outbreak should be “2019-nCoV acute respiratory disease”
• Jan. 29WHO states that the mortality rate is estimated at 2.0% but still to early to tell. Praises China for its incredible measures to contain the virus.
• Jan. 27
  WHO admits an error in its previous risk assessment of the virus and states declares the risk to be «very high in China, high at the regional level and high at the global level.» explaining that it has stated «incorrectly» in its previous reports on January 23, 24, and 25 that the global risk was «moderate».
• Jan. 23
  WHO declares the outbreak an «emergency in China», but stops short of calling it a global health emergency.
• Jan. 20 (Human to human transmission confirmed)
• Jan. 15 — Jan 20 (The virus spreads to other countries, including Japan and the United States)
• Jan. 13 (First case outside of China)
  WHO: «The possibility of cases being identified in other countries was not unexpected, and reinforces why WHO calls for ongoing active monitoring and preparedness in other countries. The patient’s full exposure history is under investigation. She reported a history of visiting a local fresh market in Wuhan on a regular basis prior to the onset of illness on January 5, 2020; however, she did not report visiting the Hunan South China Seafood Market from where most of the cases were detected.»
• Jan. 12 (China shares the genetic sequence of the novel coronavirus for countries to use in developing specific diagnostic kits)
  The WHO says that according to the preliminary epidemiological investigation, most cases worked at, or were handlers and frequent visitors to the seafood market and that «the government reports that there is no clear evidence that the virus passes easily from person to person.»
• Jan. 9 (First death: a 61-year-old man from Wuhan)
  WHO: «according to Chinese authorities, the virus in question can cause severe illness in some patients and does not transmit readily between people.»
• January 7 (Novel virus identified and named 2019-nCoV)
  The WHO finds that the new virus is a new strain of coronavirus. The source is still unknown, but most likely comes from animals.
• December 31, 2019
  The WHO says it had been alerted to a «cluster of cases of pneumonia of unknown cause» in Wuhan, China.

Close Contact (6 feet, 1.8 meters) and Respiratory Droplets

Objects and Surfaces

Examples of possible development of symptoms (from actual cases)

Floor

«The rate of positivity was relatively high for floor swab samples (ICU 7/10, 70%; GW 2/13, 15.4%), perhaps because of gravity and air flow causing most virus droplets to float to the ground.

In addition, as medical staff walk around the ward, the virus can be tracked all over the floor, as indicated by the 100% rate of positivity from the floor in the pharmacy, where there were no patients.

Furthermore, half of the samples from the soles of the ICU medical staff shoes tested positive. Therefore, the soles of medical staff shoes might function as carriers. The 3 weak positive results from the floor of dressing room 4 might also arise from these carriers. We highly recommend that persons disinfect shoe soles before walking out of wards containing COVID-19 patients.»

80% of cases are mild

Статистика заражений коронавирусом по регионам России на сегодня, 23 декабря 2020

Регион
Заражено
Вылечено
Погибло
% Смертей

Москва
756586+5652
582772+5228
10613+73
1.4%

Санкт-Петербург
212074+3749
123518+2617
7074+75
3.34%

Московская область
142744+1540
101262+1234
2724+5
1.91%

Нижегородская область
65805+498
58669+415
1516+13
2.3%

Свердловская область
55341+402
47658+405
1376+16
2.49%

Ростовская область
48547+379
39193+384
1887+28
3.89%

Красноярский край
43907+331
37550+448
1551+21
3.53%

Воронежская область
43110+391
41415+379
986+16
2.29%

Архангельская область
40358+393
31086+388
400
0.99%

Ханты-Мансийский автономный округ — Югра
39508+225
35424+228
510+5
1.29%

Иркутская область
38385+269
33591+286
1124+15
2.93%

Ульяновская область
34057+286
30969+245
435
1.28%

Мурманская область
33943+276
31120+273
602+3
1.77%

Волгоградская область
33215+274
31494+277
419+6
1.26%

Саратовская область
33143+270
28490+198
370+7
1.12%

Ставропольский край
33130+244
29702+268
680
2.05%

Хабаровский край
32359+345
27774+508
198+2
0.61%

Челябинская область
32223+305
22988+33
470+9
1.46%

Алтайский край
31194+215
28612+243
781+13
2.5%

Ямало-Ненецкий автономный округ
30716+178
23013+218
312+2
1.02%

Самарская область
28946+307
26684+292
540
1.87%

Омская область
28139+241
25517+238
812+9
2.89%

Республика Коми
28072+281
24972+369
534+9
1.9%

Пермский край
27985+335
22098+374
1028+20
3.67%

Приморский край
27379+240
19356+176
339+6
1.24%

Оренбургская область
27310+176
23845+173
305+3
1.12%

Новосибирская область
26632+161
22454+233
902+7
3.39%

Краснодарский край
26224+188
17696+124
822+13
3.13%

Забайкальский край
25261+249
23048+251
359+1
1.42%

Республика Саха (Якутия)
24841+193
22287+190
363+5
1.46%

Кемеровская область (Кузбасс)
24595+147
21455+176
451+2
1.83%

Республика Карелия
24575+374
17385+354
144+3
0.59%

Пензенская область
24451+198
19989+129
298+2
1.22%

Республика Бурятия
24164+203
21544+112
552+5
2.28%

Кировская область
23662+243
16966+241
220+1
0.93%

Томская область
22925+189
18387+204
206
0.9%

Республика Крым
22463+353
16938+264
444+8
1.98%

Республика Дагестан
22202+158
19061+120
1078+5
4.86%

Тюменская область
22084+166
20703+159
190+4
0.86%

Ленинградская область
21997+224
19795+233
207+7
0.94%

Брянская область
21528+207
18948+38
216+2
1%

Тульская область
21181+207
18552+189
671+14
3.17%

Ярославская область
20774+190
19453+183
159+4
0.77%

Вологодская область
20563+374
15796+368
342+9
1.66%

Тверская область
20370+235
15045+306
435
2.14%

Белгородская область
20338+188
18452+139
216+5
1.06%

Псковская область
20037+416
10295+258
96
0.48%

Орловская область
19936+175
17856+209
247+2
1.24%

Ивановская область
19762+179
14710+226
444+12
2.25%

Калужская область
19690+173
18392+165
153+3
0.78%

Курская область
19328+182
17512+174
275+3
1.42%

Удмуртская Республика
17909+206
14363+199
363+1
2.03%

Республика Башкортостан
17741+161
13928+82
128+2
0.72%

Астраханская область
17584+183
11996+93
348+5
1.98%

Владимирская область
17134+184
15411+171
421+2
2.46%

Рязанская область
17041+136
15551+131
134+5
0.79%

Новгородская область
16635+212
12041+142
98
0.59%

Тамбовская область
16402+153
14585+312
166+2
1.01%

Республика Хакасия
16200+180
13162+178
230+12
1.42%

Калининградская область
16084+203
12793+274
155
0.96%

Смоленская область
15762+157
11990+192
314+7
1.99%

Чувашская Республика
15454+125
13790+118
443+12
2.87%

Кабардино-Балкарская Республика
15004+101
12966+131
251+1
1.67%

Амурская область
14761+140
13175+135
105
0.71%

Липецкая область
14737+166
11145+102
218+7
1.48%

Сахалинская область
14568+148
11348+114
14
0.1%

Карачаево-Черкесская Республика
14396+91
12820+84
38
0.26%

Республика Тыва
14328+64
13083+48
157
1.1%

Костромская область
14126+112
10475+110
211+1
1.49%

Республика Калмыкия
13953+110
11436+44
190+4
1.36%

Республика Алтай
13240+57
12597+60
83+3
0.63%

Республика Мордовия
12790+86
10495+84
83
0.65%

Республика Татарстан
12480+102
10555+22
171+1
1.37%

Республика Ингушетия
11424+88
9505+29
130+3
1.14%

Республика Северная Осетия — Алания
11306+88
10038+78
85
0.75%

Курганская область
11149+105
9847+101
152+3
1.36%

Республика Адыгея
10313+90
8251+97
80
0.78%

Камчатский край
9483+77
8365+69
82
0.86%

Республика Марий Эл
8775+53
7786+46
113
1.29%

Чеченская Республика
7587+146
3546+77
88
1.16%

Магаданская область
6686+38
6171+42
61
0.91%

Севастополь
6094+83
5667+110
207+5
3.4%

Еврейская автономная область
3595+27
2485+30
62
1.72%

Ненецкий автономный округ
754+3
678
—
0%

Чукотский автономный округ
499+1
432
4
0.8%

Показать все

Airborne Transmission

The WHO states that «Respiratory infections can be transmitted through droplets of different sizes: when the droplet particles are >5-10 μm in diameter they are referred to as respiratory droplets, and when they are <5μm in diameter, they are referred to as droplet nuclei. According to current evidence, COVID-19 virus is primarily transmitted between people through respiratory droplets and contact routes»

The WHO defines airborne transmission as «the spread of an infectious agent caused by the dissemination of droplet nuclei that remain infectious when suspended in air over long distances and time»

Air Distance: up to 4 meters (13 feet) might be possible (in hospitals)

«The maximum transmission distance of SARS-CoV-2 aerosol might be 4 m» (13.1 feet), according to a study published on April 10 on Emerging Infectious Diseases, a journal of the US CDC which also found that «SARS-CoV-2 was widely distributed in the air and on object surfaces in both the ICU and general ward (GW), implying a potentially high infection risk for medical staff and other close contacts»

This is true in a hospital setting and doesn’t necessarily apply to other settings. The WHO says that «in the context of COVID-19, airborne transmission may be possible in specific circumstances and settings in which procedures or support treatments that generate aerosols are performed; i.e., endotracheal intubation, bronchoscopy, open suctioning, administration of nebulized treatment, manual ventilation before intubation, turning the patient to the prone position, disconnecting the patient from the ventilator, non-invasive positive-pressure ventilation, tracheostomy, and cardiopulmonary resuscitation»

And concludes that «further studies are needed to determine whether it is possible to detect COVID-19 virus in air samples from patient rooms where no procedures or support treatments that generate aerosols are ongoing»

Air Duration: up to 3 hours (but not in normal conditions, according to WHO)

Virus can remain viable «in aerosols up to 3 hours» found a study published in The New England Journal of Medicine on March 17

The WHO notes that these findings need to be interpreted carefully: «in this experimental study, aerosols were generated using a three-jet Collison nebulizer and fed into a Goldberg drum under controlled laboratory conditions. This is a high-powered machine that does not reflect normal human cough conditions. Further, the finding of COVID-19 virus in aerosol particles up to 3 hours does not reflect a clinical setting in which aerosol-generating procedures are performed — that is, this was an experimentally induced aerosol-generating procedure»

Семейство коронавирусов и их классификация

Возбудителем COVID-2019 является определенный класс вирусов. Вирусы – это инфекционные агенты (паразиты), которые, проникая в клетки организма хозяина (человека, животного, растения), становятся причиной болезни. Зависимо от структуры различают разные виды вирусов: РНК-содержащие и ДНК-содержащие, которые в свою очередь вызывают различные типы заболеваний. Именно вирусы являются причиной респираторных, многих желудочно-кишечных, неврологических и других инфекций. Коронавирусы, о которых пойдет речь дальше, принадлежат к классу РНК-содержащих паразитов, вызывающих респираторные заболевания .

Коронавирусы (Coronaviridae) – это довольно большой перечень вирусов, которые способны инфицировать как животных, так и человека, вызывая респираторные синдромы разной сложности. Принадлежат к II группе патогенности.

Свое название они получили благодаря особому строению. На теле вируса есть специфические шиповидные отростки, из-за чего он выглядит как солнечная корона. Жизненный цикл всех коронавирусов примерно одинаковый. С помощью этих отростков коронавирус маскируется под молекулы S-протеинов, на которые реагируют особые рецепторы клеточной мембраны. Они захватывают «самозванцев» с «короной», после чего вирус с легкостью проникает внутрь клетки. Кстати, сравнение SARS-CoV-2 (возбудитель COVID-2019) и SARS-CoV-1 показало, что первый легче сцепляется с рецепторами, из-за чего заражение происходит намного легче. Это отличие делает его крайне опасным.

Проникая внутрь клетки, вирус начинает собирать свои белки в рибосоме, которая не может определить, является ли это РНК вируса или полезных для клетки белков. Уникальность коронавирусов в том, что они имеют очень крупные несегментированные РНК, из-за чего являются наиболее сложными среди всех вирусов по структуре. Из-за этого бороться с ними намного сложнее, чем с более простыми агентами .

Современная классификация вирусов довольно сложная. Если говорить отдельно о семействе Coronaviridae, то оно, наряду с Arteriviridae и Roniviridae, входит в отряд Nidovirales (вирусы, которые содержат одноцепочечную РНК). Что касается разновидностей коронавирусов, то на январь 2020 года ученым были известны, как минимум, 40 видов . Большинство из них впервые были обнаружены в 1930-х годах у домашних птиц. У животных они вызывают респираторные, неврологические, печеночные и желудочно-кишечные заболевания. Коронавирус человека впервые выделили D. Tyrrell и M. Bynoe в 1965 году от пациента с ОРЗ .

Человека поражают только 7 из известных на сегодня коронавирусов. И самые распространенные среди них: HCoV-229E, -OC43, -NL63 и -HKU1. Обычно они поражают верхние дыхательные пути, вызывая заболевания легкой или средней тяжести . Кроме того, как свидетельствуют научные данные, у большинства людей есть специфические антитела, благодаря которым вырабатывается устойчивость к наиболее распространенным коронавирусам .

Семейство Coronaviridae состоит из 2 подсемейств:

• Coronavirinae;
• Torovirinae.

Особый интерес для вирусологов представляет Coronavirinae. Это семейство включает в себя 4 рода вирусов:

• Alpha-;
• Beta-;
• Gamma-;
• Deltacoronavirus.

Род Betacoronavirus считается наиболее опасным для человека. Он содержит 4 подрода:

• A (включает бетакоронавирус 1 – BetaCoV 1, коронавирус человека – HCoV HKU1, коронавирус мышиных – MCoV, коронавирус кроликов – RbCoV HKU14);
• B (SARS-CoV);
• C (MERS-CoV, коронавирус нетопырей – Pi-BatCoV HKU5, косолапых кожанов – Ty-BatCoV HKU4);
• D (коронавирус ночных крыланов – Ro-BatCoV HKU9).

Torovirinae состоит из 2 родов:

• Torovirus;
• Bafinivirus.

Переносчиками большинства известных на сегодня коронавирусов являются млекопитающие.