Секретная история первого коронавируса

Содержание:

Similar articles
Стоимость
Когда впервые стало известно про COVID-19
Старый добрый карантин
Коронавирус SARS-CoV. Ключевые факты
Рекомбинационный анализ
Неврологические заболевания
Как лечили коронавирусы раньше
Профилактика
This section provides information on sequence similarities with other proteins and the domain(s) present in a protein.More…Family & Domainsi
Виром Манхэттена
Симптомы нарушения функции пищеварительной системы
Симптомы коронавируса
- Первые признаки заражения коронавирусом
- Основные симптомы коронавируса
Вирус SARS-CoV-2
Классификация коронавирусов (Coronaviridae) по ICTV:
Как получить результат

Стоимость

История коронавируса covid-19 (ковид-19) как нового субъекта общественных отношений Название услуги	Цена (руб.)
Панель ОРВИ методом ПЦР с забором мазков медсестрой на дому	5 900*
Программа наблюдения терапевта (консультация на дому с забором мазков, панель ОРВИ методом ПЦР, дистанционное сопровождение после консультации)	8 650**
Программа наблюдения терапевта — ведущего специалиста (консультация на дому с забором мазков, панель ОРВИ методом ПЦР, дистанционное сопровождение после консультации)	9 520**
Доставка результатов анализов на дом курьером	250***

*Цена указана за исследование и забор мазков на дому в будний день, в пределах КАД, мед.персонал выезжает на следующий день от заявки. При выезде в выходной день и/или за пределы КАД и/или в день заявки применяются повышающие коэффициенты. В этом случае уточняйте окончательную стоимость у координатора.

**Цены программ указаны с учетом выезда врача в будний день, до 18:00, в пределах КАД. При выезде врача в выходной день и/или после 18:00 и/или за пределы КАД применяются повышающие коэффициенты. В этом случае уточняйте окончательную стоимость у координатора.

***Цена указана за выезд курьера в пределах КАД. При доставке на адрес за пределами КАД применяются повышающие коэффициенты. В этом случае уточняйте окончательную стоимость у оператора.

Записаться

38-002-38 (круглосуточно)

Когда впервые стало известно про COVID-19

Краткая история пандемии: статистика страшных инфекций

Новый коронавирус, именуемый 2019-nCoV или инфекцией Уханя, впервые был обнаружен в конце 2019 г. Изначально им заразились люди, посещающие местные рыбные точки на рынке. 20 января 2020 года медики впервые подтвердили передачу вирусной инфекции от человека к человеку.

Инфекционная патология распространяется воздушно-капельным путем, как и любая другая болезнь легких. Ситуацию усложнил тот момент, что на момент вспышки в Китае был канун Нового года, а провинция Ухань — крупный городской транспортный узел. По традиции китайцы много перемещаются в праздничные каникулы, стремясь погостить у родных или друзей. Как показала практика, из эпицентра болезни уехали сотни тысяч людей, они и заразились коронавирусом.

Старый добрый карантин

Специальные транспортные системы virocult® для вирусов с жидкой средой

Напомним, что именно жесточайшим карантином задавили опаснейшую вспышку вируса MERS-CoV, которая произошла в Южной Корее в мае 2015 года. Тогда смертность составила 18% — из 183 заболевших людей за какой-то месяц скончалось 33 человека. Однако широкого распространения MERS-CoV в Южной Корее удалось избежать — в том числе благодаря тому, что все заболевшие и их цепочки контактов были своевременно выявлены, а правительство Южной Кореи закрыло около 2199 школ и других учебных заведений, в том числе 19 университетов.

Сейчас все страны пытаются любыми способами обнаружить у себя дома «пациентов №0», которые могли прибыть из Китая с заразой в организме, и устранить причину, а не бороться с последствиями. Ну а Китаю, к сожалению, приходится уже идти на крайние меры.

Выбор тут невелик: лишь тотальный карантин является барьером на пути распространения «быстрых» вирусов, когда зараженный человек заболевает в течение дней или максимум недель. Против SARS-CoV, MERS-CoV и 2019-nCoV и других коронавирусов пока нет эффективных вакцин, а все лечение направлено лишь на создание максимально быстрого естественного иммунного ответа заболевшего организма на инфекцию и облегчение негативных последствий.

Сегодня из-за такой особенности заболевания вирусом пациенты в основном получают симптоматическую и поддерживающую терапию. Однако уже известно, что сопутствующие воспаление и отек легких, вызванные коронавирусом 2019-nCoV, хорошо лечатся путем экстракорпоральной оксигенации (ЭКМО) — принудительного насыщения крови кислородом непосредственно через кровь с помощью внешнего мембранного прибора-оксигенатора.

Дело в том, что при вирусной пневмонии развивается острая дыхательная недостаточность, которую организм часто не в силах побороть самостоятельно. Однако «искусственные легкие» позволяют избежать гибели пациента и пройти острый период до выработки собственного иммунитета у заболевшего. Проблемой ЭКМО пока является малое число аппаратов, сложность проведения и высокая стоимость такой процедуры.

В целом, рекомендации по недопущению заражения 2019-nCoV выглядят ровно так же, как и для других вирусов: максимально часто мойте руки с мылом или дезинфицирующим средством, не касайтесь грязными руками слизистых, глаз или рта, избегайте тесного контакта с зараженными людьми и максимально ограничьте свое пребывание в местах массового скопления людей.

Остальное пусть делают государственные службы. Именно они имеют сейчас реальную возможность остановить распространение опасного вируса.

Коронавирус SARS-CoV. Ключевые факты

Тяжелый острый респираторный синдром (SARS, ТОРС, атипичная пневмония), вирусное заболевание вызванное коронавирусом SARS-CoV, впервые выявленное в Китае в 2002 году. В 2003 году был верифицирован возбудитель заболевания, впоследствии названный SARS-CoV
Типичные симптомы SARS включают повышенную температуру тела, кашель, одышку.
Каждый десятый случай заболевания SARS заканчивался летальным исходом
Основным путем передачи инфекции являлся контактно-фомитный
С 2004 года не зафиксировано ни одного случая SARS
Вспышка SARS-CoV дала толчок новым исследованиям коронавирусов, вследствие чего были открыты еще два вируса HCoV-NL63 и HCoV-HKU1 распространённых по всему миру.

Рекомбинационный анализ

В результате своего уникального случайного переключения матриц во время репликации РНК, который, как считается, опосредуется механизмом «выбора копии», коронавирусы имеют высокую частоту гомологичной рекомбинации РНК.

Впервые рекомбинация в коронавирусах была выявлена между различными штаммами MHV и впоследствии в других коронавирусах, таких как IBV, между MHV и BCoV, а также между кошачьим коронавирусом (FCoV) I типа и коронавирусом собак (CCoV). Как показано ниже, такая рекомбинация может приводить к образованию видов коронавирусов или различных генотипов внутри видов коронавирусов. По общему мнению, возможность гомологичной рекомбинации РНК и возможную часть генома, в которой произошла рекомбинация, обычно сначала оценивают с использованием бутсканированного анализа или филогенетического анализа с использованием различных частей генома коронавируса.

Другие методы для рекомбинационного анализа, такие как те в пакете RDP3, также доступны. Тогда точный тип гомологичной рекомбинации РНК лучше всего будет выявлен путем множественного выравнивания последовательностей.

Лучшим документированным примером генерации видов коронавирусов посредством гомологичной рекомбинации РНК является генерация FCoV типа II путем двойной рекомбинации между FCoV типа I и CCoV. Впервые было отмечено, что последовательность белка S в FCoV типа II была тесно связана с последовательностью CCoV, но последовательность ниже по течению от гена E в FCoV типа II была более тесно связана с последовательностью штамма FCoV типа I чем в CCoV. Это наблюдение предположило, что, возможно, произошел гомологичный случай рекомбинации РНК между геномами CCoV и FCoV типа I, что привело к генерации FCoV типа II.

Дальнейший анализ путем множественного выравнивания последовательностей выявил сайт рекомбинации в области в гене E. Несколько лет спустя была обнаружена дополнительная область рекомбинации в гене Pol, и был сделан вывод, что FCoV типа II возник в результате двух событий рекомбинации между геномами CCoV и FCoV типа I.

Что касается генерации различных генотипов у видов коронавирусов посредством гомологичной рекомбинации РНК, лучшим документально подтвержденным примером является HCoV-HKU1. Возможность гомологичной рекомбинации РНК впервые была заподозрена, когда несколько штаммов HCoV-HKU1 продемонстрировали дифференциальную кластеризацию, когда гены Pol, S и N были использованы для построения филогенетического дерева. Это наблюдение привело к последующему исследованию полного секвенирования генома 22 штаммов HCoV-HKU1.

Рекомбинационный анализ методом бутскана и филогенетический анализ с использованием различных частей 22 полных геномов выявил обширную рекомбинацию в различных частях геномов, что привело к образованию трех генотипов, A, B и C, HCoV-HKU1. Используя множественное выравнивание последовательностей, были точно определены два сайта рекомбинации.

Первый наблюдался на участке из 143 нуклеотидов около 3′-конца nsp6, где рекомбинация между генотипом B HCoV-HKU1 и генотипом C породила генотип A и второй в другом участке из 29 нуклеотидов около 3′-конца nsp16, где рекомбинация между генотипом A HCoV-HKU1 и генотипом B породила генотип C.

После эпидемии атипичной пневмонии отмечается заметное увеличение числа обнаруженных коронавирусов и секвенирование геномов коронавирусов. Это увеличение количества видов и геномов коронавирусов, всеобъемлющей и удобной для пользователя базы данных для эффективного поиска последовательностей и постоянно совершенствующихся инструментов биоинформатики позволило исследователям проводить значимый геномный, филогенетический, эволюционный уровень и расхождение, рекомбинацию и другие биоинформатические анализы на семействе Коронавирид.

Три разновидности (рода) коронавирусов: альфа-коронавирус , бета-коронавирус и гамма-коронавирус, были использованы для замены традиционных коронавирусов группы 1, 2 и 3. Вероятно, появится четвертый род, Deltacoronavirus, который включает BuCoV HKU11, ThCoV HKU12 и MunCoV HKU13. В соответствии с этой новой системой классификации коронавирусы летучих мышей доминируют над родами альфа-коронавируса и бета-коронавируса, а коронавирусы птиц доминируют над родами гамма-коронавируса и дельтакоронавируса. Это огромное разнообразие коронавирусов у летучих мышей и птиц сделало их превосходными генофондами для коронавирусов этих четырех родов.

Неврологические заболевания

Точно установленный факт влияния нескольких видов коронавирусов животных на развитие острых и хронических неврологических патологий заставил ученых исследовать аналогичную патогенность коронавирусов человека. HCoVs (коронавирусы человека) способны инфицировать нервные клетки in vitro, а исследования на мышах продемонстрировали развитие генерализованного энцефалита через 3 недели после внутримозгового введения вируса HCoV-OC43. Последовательности РНК HCoV-OC43 были обнаружены в ликворе 15-летнего мальчика с острым демиелинизирующим энцефаломиелитом (ОДЭМ). В еще одном отчете РНК HCoV-OC43 была выявлена в ткани головного мозга с широко распространенным мозговым иммуногистохимическим окрашиванием при аутопсии 11-месячного мальчика с выраженным комбинированным иммунодефицитом и острым энцефалитом после трансфузии пуповинной крови.

Ввиду того, что у мышей и летучих мышей, инфицированных определенными штаммами MHV (вируса гепатита мышей), развивался тяжелый демиелинизирующий энцефалит, похожий на рассеянный склероз, ученые пытались связать коронавирусы с рассеянным склерозом. Однако имеющиеся на сегодняшний день доказательства нельзя назвать убедительными. Известно, что T-клеточные клоны больных с рассеянным склерозом реагируют как на антигены HCoV-229E, так и на базовый протеин миелина (MBP), что свидетельствует о молекулярной мимикрии как основного патогенеза. Некоторые (не все) ученые обнаруживали РНК коронавирусов человека (HCoV-OC43 и HCoV-229E) чаще в тканях мозга у больных с рассеянным склерозом путем ПЦР-анализа, чем у здоровых людей.

Нужно отметить, что эти данные и другие сведения об этиологической связи между коронавирусами человека и рассеянным склерозом или другими демиелинизирующими патологиями на сегодняшний день нельзя использовать в качестве доказательств.

Как лечили коронавирусы раньше

Виды коронавируса: a — HCoV-229E, HCoV-b — NL63, c — HCoV-OC43 и d — HCoV-HKU1

Коронавирус 229E, также, как и обнаруженный через два года коронавирус ОС-43, причислили к возбудителям острых респираторных заболеваний человека и животных, однако не относили их к числу особо опасных вирусных инфекций.

Даже несмотря большой интерес со стороны средств массовой информации, научное сообщество не уделяло должного внимания исследованиям. Пресса писала, что наука утроила свой шанс в конечном итоге победить простуду, в то время как ученые не стали уделили должного внимания коронавирусам.

Поскольку коронавирусы 229E и OC43 вызывали относительно легкие заболевания у людей, врачи могли лечить их так же, как простудные заболевания, вызванные другими вирусами. Так продолжалось почти 40 лет до появления SARS в 2003 году.

Профилактика

Профилактика коронавирусной инфекции включает в себя:

Тщательное соблюдение правил личной гигиены – мыть руки, в коллективах использовать только личные кухонные приборы/посуду, а после прихода с магазина, омывать упаковки продуктов, которые можно помыть.
Держать дистанцию от людей с признаками ОРЗ, а в период эпидемии/пандемии, вообще держать дистанцию от других людей на 1,5-2 метра;
В период эпидемии, избегайте мест большого скопления людей (ТРЦ, концерты, кинотеатры и пр.), при возможности, вместо общественного транспорта используйте ноги – если пройтись небольшое расстояние;
Не касайтесь немытыми руками частей своего лица, особенно носа, рта, глаз;
Старайтесь кушать больше продуктов, богатых на витамины и минералы, и в то же самое время меньше кушать малополезную и вредную пищу (фастфуды и пр.);
В общественных местах используйте средства индивидуальной защиты – маски, это снизит риск подхватить инфекцию не только вам от носителя инфекции, но и другому человеку, если носителем стали вы, т.е. это является и взаимоуважением друг ко другу, ведь иногда коронавирус и прочие вирусные инфекции могут протекать в скрытой, практически бессимптомной форме.
Обрабатывайте дезинфекторами свой смартфон и прочие поверхности, с которыми Вы периодически контактируете – клавиатура, мышь, ручка, кошелек и т.д.
В период пандемии, избегайте тесного контакта при приветствии – рукопожатия, обнимания, целования;
Не оставляйте на самотек различные болезни, во избежание их хронизации и дальнейших обострениях при воздействии неблагоприятных факторов.

This section provides information on sequence similarities with other proteins and the domain(s) present in a protein.More…Family & Domainsi

Domains and Repeats

Feature key	Position(s)	DescriptionActions	Graphical view	Length
Domaini	15 – 302	BetaCoV S1-NTDPROSITE-ProRule annotationAdd BLAST		288
Domaini	333 – 607	BetaCoV S1-CTDPROSITE-ProRule annotationAdd BLAST		275

Region

Feature key	Position(s)	DescriptionActions	Length
Regioni	318 – 624	Receptor-binding domainUniRule annotationAdd BLAST	307
Regioni	904 – 925	Fusion peptide 1UniRule annotationAdd BLAST	22
Regioni	923 – 943	Fusion peptide 2UniRule annotationAdd BLAST	21
Regioni	1004 – 1054	Heptad repeat 1UniRule annotationAdd BLAST	51
Regioni	1248 – 1286	Heptad repeat 2UniRule annotationAdd BLAST	39

Coiled coil

Feature key	Position(s)	DescriptionActions	Graphical view	Length
Coiled coili	1033 – 1077	UniRule annotationAdd BLAST		45
Coiled coili	1259 – 1287	UniRule annotationAdd BLAST		29

Compositional bias

Feature key	Position(s)	DescriptionActions	Graphical view	Length
Compositional biasi	1319 – 1336	Cys-richAdd BLAST		18

Domaini

Fusion peptide 1 (FP1) and fusion peptide 2 (FP2) function cooperatively and have a membrane-ordering effect on lipid headgroups and shallow hydrophobic regions of target bilayers. They are considered as two domains of an extended, bipartite FP. The membrane-ordering activity is calcium-dependent and also dependent on correct folding, which is maintained by an internal disulfide bond in FP2.UniRule annotation

Виром Манхэттена

Виром — совокупность вирусов, как геном — совокупность генов. Виром есть и у каждого человека, и у мест, например нью-йоркского района Манхэттен. Ученые делали анализы пациентам педиатрических отделений неотложной помощи и их сопровождающим, посетителям достопримечательностей, а также набрали 214 волонтеров, которые полтора года сообщали о симптомах болезни в специальном приложении (вдобавок у них еженедельно брали мазок из носоглотки).

Результаты получились такие:

В феврале, в пик сезона гриппа, каждый девятый человек заражался, но с гриппом обращались к врачу только 22% больных, а с коронавирусными инфекциями — всего 4%. Поскольку большинство не учтено, часто невозможно восстановить цепочку распространения вирусов. Команда «Вирома Манхэттена» вместе с другими учеными рассчитала, что до введения карантина в Ухане в январе 2020 года 86% заражений остались незамеченными.
Во время сезонов гриппа 137 человек заразились одним из «простудных» коронавирусов, 12 из них заболели повторно в течение 4–48 недель. Объяснений может быть два: либо иммунитет быстро слабеет, либо коронавирусы мутируют и проскальзывают незамеченными. Как обстоит дело с SARS-CoV-2, пока непонятно, а это один из главных вопросов в пандемию.
Другие коронавирусы, в том числе HCoV-OC43 и HCoV-HKU1, похожие на SARS-CoV-2, — сезонные, то есть их распространение зависит от времени года. Но пока нельзя сказать, таков ли новый коронавирус. Руководитель «Вирома Манхэттена» в этом сомневается.

Скоро команда проекта рассчитывает опубликовать статьи с новыми результатами, касающимися и SARS-CoV-2.

Подготовил Марат Кузаев

Симптомы нарушения функции пищеварительной системы

Бытует мнение, что коронавирусная инфекция человека вызывает диарею… Такое представление обусловлено кишечной патогенностью коронавирусов у животных. Выводы ранних исследований на людях были основаны на обнаружении «коронавирусных частиц» в кале (с помощью электронной микроскопии). Другие, более убедительные исследования продемонстрировали значительную зависимость между наличием коронавирусных частиц в кале и диареей у младенцев, или некротизирующим энтероколитом у новорожденных. В некоторых исследованиях удалось получить коронавирусные частицы, которые, вероятно, были антигенно связанными с HCoV-OC43.

Все четыре вида коронавирусов, рассматриваемые в этом разделе, были обнаружены с помощью анализа ПЦР в кале небольшой части младенцев и детей, госпитализированных по поводу диареи (у некоторых также отмечались респираторные симптомы). В трех исследованиях диареи использовали молекулярные методы диагностики для всех четырех видов HCoV. В одном исследовании все четыре вида обнаружили в образцах кала у 2,5% (из 878) детей с диареей и у 1,8% (из 112) бессимптомных детей с помощью ПЦР-теста (однако в этом и других исследованиях большинство ассоциированных с диареей коронавирус-положительных образцах кала были обнаружены и другие известные патогенные возбудители, например, норовирус или ротавирус). В исследовании, в котором использовали ПЦР-тест для исследования частоты коронавирусов в образцах кала у детей и взрослых с патологиями желудочно-кишечного тракта, вирус CoV-HKU1 был обнаружен у 4 из 479 больных (0,8%), другие виды коронавирусов обнаружены не были.

Исследование позволило оценить наличие связи между нарушениями функций желудочно-кишечного тракта (боль в животе, тошнота, рвота, диарея) у взрослых с респираторными симптомами, а также с системными симптомами или признаками (повышение температуры тела, озноб, миалгия, головная боль), которые были известны семейным врачам (врачам общей практики). Симптомы нарушения пищеварительной системы, которые наблюдались у 57% больных, чаще возникали у пациентов с повышением температуры тела > 39°C, головной болью, желудочно-кишечным возбудителем или респираторной инфекцией HCoV. Хотя в некоторых образцах кала было обнаружено несколько видов коронавирусов, ученые допустили, что это могли быть проглоченные вирусы. Патогенетический механизм симптомов нарушения функции желудочно-кишечного тракта и внутренних проявлений инфекции остается неизученным.

Симптомы коронавируса

Инкубационный период коронавируса составляет от 2 до 10 суток, в зависимости от вида и штамма инфекции.

Большинство инфицированных становится заразным только с появлением первых признаков болезни. Однако, как сообщают различные ученые и медицинские работники, нововыявленный в Китае 2019-nCoV распространяется еще в период инкубации, т.е. человек становится заразным еще до того, как у него появилась симптоматика.

Кроме того, различные виды коронавируса могут вызывать различную локализацию поражения – некоторые проявляются преимущественно в ЖКТ, другие в органах дыхания.

Первые признаки заражения коронавирусом

Начало болезни у большинства людей острое и проявляется в виде умеренной лихорадки;
Першение в горле, покашливание;
Зуд в носу, чиханье;
Головная и мышечная боль.

Основные симптомы коронавируса

Повышенная и высокая температура тела 38-39 °C, озноб;
Головные боли, головокружение;
Ринит с большим количеством серозных выделений, отечность слизистых в носу;
Слабость, общее недомогание, повышенная утомляемость;
Сухость в горле, першение, кашель, небольшая боль в горле;
При аускультации в случае тяжелого поражения врач может услышать хрипы;
Одышка, ощущение нехватки воздуха;
Тахикардия;
При поражении ЖКТ могут появиться – гастроэнтерит, тошнота, диарея, приступы рвоты.

После перенесенной болезни у пациента вырабатывается непродолжительный иммунитет, которые не защищает человека от повторного заражения.

Вирус SARS-CoV-2

В конце декабря 2019 года подразделение Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) в Китае зарегистрировало вспышку пневмонии неизвестного происхождения. В начале января 2020 года был определен возбудитель заболевания — коронавирус, родственный возбудителям тяжелого острого респираторного синдрома (SARS) и ближневосточного респираторного синдрома (MERS). Позднее разновидность вируса была названа SARS-CoV-2, а вызываемое им заболевание — COVID-19 (от английского Corona Virus Disease). 11 марта 2020 года ВОЗ официально объявила о начале пандемии нового заболевания .

Что такое коронавирусы?

В 1965 году британские вирусологи Тайрелл и Бино, изучавшие возбудителей обычной простуды, культивировали новый вирус под названием B814 . Позднее, в ходе микроскопических исследований, Дэвид Тайрелл и его коллеги обнаружили сходство строения этого вируса и нескольких возбудителей заболеваний животных: вируса инфекционного бронхита птиц, вируса гепатита мышей и вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней . Вирусы были преимущественно округлой или овальной формы, а на их поверхности были видны длинные выросты, напоминающие «корону», которая возникает вокруг солнечного диска при полном затмении. Благодаря этому группа получила название коронавирусов .

Вирусы — это крайне разнообразная группа агентов. Некоторые из них содержат только белки и генетический материал (например, вирусы обычной простуды или вирус папилломы), а у некоторых, как у гриппа или ВИЧ, есть оболочка, которую вирус похищает из клетки хозяина. Оболочка состоит из двойного слоя липидов, в который встраиваются белки вируса. У коронавирусов такая оболочка есть.

Геномы вирусов, в отличие от геномов бактерий или более сложных организмов, могут состоять как из ДНК, так и из РНК. У коронавирусов генетический материал представлен РНК и имеет самую большую длину из всех вирусов со сходной организацией — около 30000 нуклеотидов (структурных элементов, последовательность которых и несет информацию о строении белков вируса) . Для сравнения, геном вируса гриппа, также представленный одноцепочечной РНК, хотя и разделенной на фрагменты, суммарно примерно в 2 раза короче . Обычно, у вирусов более длинный геном означает возможность кодировать больше белков и, как следствие, вступать в более сложные взаимоотношения с клеточными системами защиты.

Среди коронавирусов ученые выделяют 4 крупные группы, названные буквами греческого алфавита — от альфа до дельта. Альфа- и бетакоронавирусы заражают млекопитающих, тогда как гамма- и дельтакоронавирусы заражают преимущественно птиц и рыб .

Коронавирусы животных, при этом могут причинять существенный экономический ущерб. Так, в 2016 году, вирус, вызывающий острую диарею у свиней, во время вспышки погубил порядка 24000 поросят .

До 2019 года было известно 6 коронавирусов, способных заражать людей. Четыре из них (HCoV‐229E, HCoV‐OC43, HCoV‐NL63 и HKU1) вызывают симптомы, похожие на обычную простуду. Два — SARS‐CoV и MERS‐CoV могут заражать нижние дыхательные пути и с высокой вероятностью приводить к тяжелой пневмонии или даже смерти больного .

Атипичная пневмония и ближневосточный респираторный синдром

До начала 2000-х годов коронавирусы человека не воспринимались как серьезная опасность. В 2002 году в южных областях Китая произошла эпидемия тяжелого острого респираторного синдрома (SARS, также известного как атипичная пневмония), вызываемого новым на тот момент коронавирусом SARS-CoV . Вспышка затронула более 8000 человек, чуть меньше 1000 из которых погибли . В 2012 году распространение другого родственного вируса MERS-CoV привело ко вспышке заболевания ближневосточным респираторным синдромом, в результате которой заразилось 2066 человек и умерло 720. Эта эпидемия затронула преимущественно Саудовскую Аравию, хотя случаи были отмечены в 27 странах .

Оба этих коронавируса имели зоонозное происхождение — они передались людям, соответственно, от цивет (род мелких хищных млекопитающих) и верблюдов, которые, в свою очередь, получили эти вирусы от летучих мышей .

Классификация коронавирусов (Coronaviridae) по ICTV:

1. Letovirinae (летовирусы)

1.2. Alphaletovirus (Альфалетовирус)

1.2.1. Milecovirus

Microhyla letovirus 1

2. Orthocoronavirinae (ортокоронавирусы)

2.1. Alphacoronavirus (Альфакоронавирус)

2.1.1. Colacovirus

Bat coronavirus (CDPHE15)

2.1.2. Decacovirus

Bat coronavirus HKU10
Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013

2.1.3. Duvinacovirus

Human coronavirus 229E (HCoV 229E)

2.1.4. Luchacovirus

Lucheng Rn rat coronavirus

2.1.5. Minacovirus

Ferret coronavirus
Mink coronavirus 1

2.1.6. Minunacovirus

Miniopterus bat coronavirus 1
Miniopterus bat coronavirus HKU8

2.1.7. Myotacovirus

Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011

2.1.8. Nyctacovirus

Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013

2.1.9. Pedacovirus

Porcine epidemic diarrhea virus
Scotophilus bat coronavirus 512

2.1.10. Rhinacovirus

Rhinolophus bat coronavirus HKU2

2.1.11. Setracovirus

Human coronavirus NL63
NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b

2.1.12. Tegacovirus

Alphacoronavirus 1

2.2. Betacoronavirus (Бетакоронавирус)

2.2.1. Embecovirus

Betacoronavirus 1
— Human coronavirus OC43

China Rattus coronavirus HKU24
Human coronavirus HKU1
Murine coronavirus

2.2.2. Hibecovirus

Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

2.2.3. Merbecovirus

Hedgehog coronavirus 1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Pipistrellus bat coronavirus HKU5
Tylonycteris bat coronavirus HKU4

2.2.4. Nobecovirus

Rousettus bat coronavirus GCCDC1
Rousettus bat coronavirus HKU9

2.2.5. Sarbecovirus

SARS (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS-CoV);
SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2), ранее — 2019-nCoV (2019-Novel Coronavirus).

2.3. Deltacoronavirus (Дельтакоронавирус)

2.3.1. Andecovirus

Wigeon coronavirus HKU20

2.3.2. Buldecovirus

Bulbul coronavirus HKU11
Coronavirus HKU15
Munia coronavirus HKU13
White-eye coronavirus HKU16

2.3.3. Herdecovirus

Night heron coronavirus HKU19

2.3.4. Moordecovirus

Common moorhen coronavirus HKU21

2.4. Gammacoronavirus (Гаммакоронавирус)

2.4.1. Cegacovirus

Beluga whale coronavirus SW1

2.4.2. Igacovirus

Avian coronavirus