Sars-cov-2: тяжелая борьба и прогнозы

Норки – промежуточные хозяева COVID-19?

Но некоторые исследователи придерживаются другого мнения и называют основным источником вспышки енотовидных собак – хищных ночных животных размером с лису. На звероводческих фермах Китая этих животных выращивают миллионами, а в прошлом у них уже был обнаружен SARS. Британская газета The Guardian приводит слова директора Института вирусологии берлинской больницы Шарите Кристиана Дростена:

Но могут ли промежуточным хозяином COVID-19 быть норки? По мнению исследователей, чтобы быть полностью уверенными в этом, придется сравнить генетический код вируса с образцами, взятыми у всех людей, которые работают или имеют отношение к ферме, или же перенесли болезнь. Научная группа из Вагенингена также обнаружила наличие коронавируса у фермерских кошек, поэтому министерство здравоохранения Нидерландов расширило тестирование на других животных, в частности на свиней. В министерстве полагают, что это поможет выяснить пути заражения животных и людей. Ну что ж, будем ждать результатов!

Строение возбудителя COVID-19

Однонитчатая РНК

Новый коронавирус на 83% идентичен своему предшественнику, возбудителю SARS. В составе его РНК находится информация о белках:

1. Две трети (66%) занимает информация о неструктурных белках (nsp — «non-structural proteins«), учавствующих в процессах воспроизведения вируса
2. Одна треть — это гены, кодирующие структурные белки. Они представлены спайк(S), мембранным (M), оболочечным (E — «envelop«) протеинами. Внутри находится один нуклеокапсид (N), связанный с РНК
3. Некоторая часть генома зарезервирована информацией о дополнительных белках. Некоторые из них, например orf3, уникальны для SARS-CoV-2 (читай ниже)

Неструктурные белки

Структурные белки

К структурным белкам относится нуклеокапсид (N) — единственный внутренний структурный протеин. Он связан с РНК формируя рибонуклеиновый комплекс — своего рода каркас, придающий нужную форму и оберегающий РНК. Он также взаимодействует с остальными белками, принимая участие в воспроизведении.

Спайк (S) протеин придает вириону характерную форму солнечной короны при криомикроскопии. Распологаясь на оболочке, его функцией является связь с клеткой организма человека и проникновение вируса внутрь. Состоит из двух субъедениц (S1 и S2), которые становятся самостоятельными при разрыве мостика фуриновой протеазой клетки хозяина.

S1 субъединица связывается с ангиотензин-превращающим-ферментом 2 (АПФ 2). АПФ 2 — это поверхностная, цинк-связывающая пептидаза, играющая огромную роль в регулировании артериального давления и функции сердца. АПФ 2 находится на мембранах клеток многих органов, в том числе легочных эпителиальных клеток.

S2 субъединица отвечает за пенетрацию клетки хозяина, которая происходит путем слияния двух оболочек.

Мембранный (M) протеин пожалуй единственный, который можно действительно назвать структурным — он придает характерную кривизну мембране и отвечает за ее стабильность. Это преобладающий мембранный белок.

Оболочечный (E) протеин располагается гораздо реже (до 20 на вирион) на липидной оболочке, пронизывая всю ее толщу — E-протеин является транмембранным ионным каналом. Обладает низкой активностью и считается неэссенципльным белком.

Дополнительные белки

orf3b является уникальным протеином нового коронавируса, гомологов которого не найдено в его предшественнике. Предполагают, что он играет важную роль в патогенности нового вируса, угнетая интерферон-β.

orf8 — интересный протеин, структура которого постоянно меняется, а вот сама функция его пока не ясна.

Сценарий 3:Мутации в вирусе возникли в результате естественного отбора во время переноса

Фундаментальные исследования, связанные с пассажем SARS-CoV-подобных коронавирусов летучих мышей в клеточных культурах и/или на животных моделях, ведутся в течение многих лет в лабораториях уровня 2 по биобезопасности во всем мире, и имеются документально подтвержденные случаи лабораторных утечек SARS-CoV. Поэтому мы должны изучить возможность непреднамеренного лабораторного высвобождения SARS-CoV-2. Теоретически, возможно, что SARS-CoV-2 приобрел мутации RBD (Рис. 1a) во время адаптации к пассажу в культуре клеток, как это наблюдалось ранее в исследованиях SARS-CoV. Однако обнаружение SARS CoV-подобных коронавирусов у панголинов с почти идентичными RBD обеспечивает гораздо более логичное объяснение того, как SARS-CoV-2 приобретал их посредством рекомбинации или мутации. Приобретение как многоосновного сайта расщепления, так и O-связанных гликанов также противоречит сценариям, основанным на исследованиях в культуре клеток. Новые многоосновные сайты расщепления наблюдались только после длительного прохождения вируса птичьего гриппа с низкой патогенностью in vitro или in vivo. Кроме того, гипотетическая генерация SARS-CoV-2 путем клеточной культуры или пассажа у животных потребовала бы предварительного выделения вируса-предшественника с очень высоким генетическим сходством, которое пока не было описано. Последующее образование многоосновного сайта расщепления потребовало бы повторного пассажа в клеточной культуре или у животных с рецепторами ACE2, сходными с таковыми у людей, но такое исследование также ранее не было проведено. Наконец, генерация О-связанных гликанов также вряд ли произошла из-за пассажа в клеточной культуре, поскольку такие особенности предполагают участие иммунной системы, что невозможно в условиях клеточной культуры.

Заключение и выводы

В разгар глобальной чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения разумно задаться вопросом о причинах возникновения пандемии. Детальное понимание того, как вирус животных широким шагом перешел через границы видов для столь активного заражения людей, поможет предотвратить будущие случаи зоонозного переноса. Например, если SARS-CoV-2 предварительно адаптирован к другим видам животных, то существует риск его повторного появления. Напротив, если адаптивный процесс произошел у людей, то даже если происходят повторные зоонозные переносы, они вряд ли начнут развиваться без той же серии мутаций. Кроме того, выявление ближайших родственников вируса SARS-CoV-2, циркулирующего у животных, будет в значительной степени способствовать изучению морфологии вируса, вирулентности и разработки тактики эффективной терапии. Действительно, наличие последовательности RaTG13 у летучих мышей помогло выявить ключевые мутации RBD и сайт многоосновного расщепления.

Особенности генома нового коронавируса, описанные в данном исследовании, могут частично объяснить вирулентность и контагиозность SARS-CoV-2 у людей. Хотя данные показывают, что SARSCoV-2 не является целенаправленно управляемым вирусом, в настоящее время невозможно доказать или опровергнуть другие теории его происхождения, описанные здесь. Однако поскольку мы наблюдали все заметные признаки SARS-CoV-2, включая оптимизированный RBD и многоосновный сайт расщепления, в связанных коронавирусах в природе, мы не считаем, что какой-либо искусственный лабораторный сценарий правдоподобен. Большее количество исследований может изменить баланс данных в пользу одной гипотезы по отношению к другой. Получение родственных вирусных последовательностей из животных источников было бы наиболее точным способом выявления вирусного происхождения. Например, будущее наблюдение за промежуточным или полностью сформированным многоосновным сайтом расщепления у вируса, подобного SARS-CoV-2 у животных, могло бы еще больше подкрепить гипотезы естественного отбора. Было бы также полезно получить больше генетических и морфофункциональных данных о SARSCoV-2, включая исследования на животных моделях. Идентификация потенциального промежуточного хозяина SARS-CoV-2, а также определение последовательности вируса в очень ранних случаях были бы весьма информативными. Независимо от точных механизмов, с помощью которых SARSCoV-2 возник в результате естественного отбора, постоянное наблюдение за пневмонией у людей и других животных, несомненно, имеет огромное значение.

Теория 2. SARS-CoV-2 – «дитя» лаборатории

Прежде всего, на эту мысль наталкивает факт, что вблизи Уханьского рынка, где были зафиксированы первые случаи заболевания, находится лаборатория, специализирующаяся на изучении коронавирусов. В частности ее сотрудники изучали возможности преодоления вирусами видовых барьеров.

Сторонники этой теории выдвигают несколько вариантов возможного развития событий. По одной гипотезе, могла случиться утечка вируса, адаптированного к другим видам животным, а позже он мутировал и до штамма, опасного для человека. Или же SARS-CoV-2 изначально может иметь синтетическую природу. Такое предположение выдвинули спецслужбы многих стран, в том числе Германии, Великобритании, Канады, США. Тем более, что человечество уже сталкивалось со случаями утечки вирусов из лабораторий. Такое случилось с вирусом Марбург, возбудителем тяжелой геморрагической лихорадки, в 1977 году.

В чем виноваты вирусологи из Ухани?

Основным аргументом в пользу теории китайского происхождения SARS-CoV-2, служит тот факт, что в течение последних 15 лет в Уханьском университете занимаются исследованием коронавирусов летучих мышей. Примерно за 4 года до начала пандемии доктор Ши Чжэнли, возглавляющая изучение коронавирусов, совместно с американскими исследователями пришла к выводу, что вирусы, генетически напоминающие SARS, способны напрямую передаваться от летучих мышей людям, вызывая болезнь, не поддающуюся терапии. А в марте 2019 года ученая предвидела эпидемию атипичной пневмонии, которая может начаться в Китае.

Что интересно, лаборатория, где изучали коронавирусы, находится недалеко от Уханьского рынка, ставшего начальным звеном будущей эпидемии. При этом в лаборатории категорически отрицают обвинения в разработке штамма и утечке вируса. В то же время по одной из теорий, нулевым пациентом, был не посетитель рынка, а сотрудница института вирусологии в Ухани Хуан Яньлин. Но вскоре Китай «зачистил» все упоминания об этой больной .

Какое отношение к новому коронавирусу имеют американцы?

Еще в 2013 году исследователи открыли SARS-подобный вирус SHC014-CoV, «мишенью» которого были подковоносые летучие мыши . Но спустя 2 года вирусологи из Ухани вместе с исследователями из Университета Северной Каролины из SARS и SHC014 создали вирус-химеру. Он мог инфицировать уже не только летучих мышей, но и людей. В ходе исследований на подопытных мышах было установлено, что вирус вызывает пневмонию. При этом препаратов против болезни на то время не было. Только в 2018 году была создана вакцина против этого вируса . Вскоре научное сообщество выразило свое недовольство подобными экспериментами, опасаясь, что просочившись за пределы лаборатории, вирус окажет серьезную опасность для человечества .

Когда вспыхнула пандемия, многие вспомнили о SHC014. Однако группа ученых из Северной Каролины, Огайо и Пенсильвании опровергли связь между SARS-CoV-2 и вирусом-химерой, аргументируя свою мысль существенными отличиями в генетических кодах этих двух вирусов .

Что необычного в SARS-CoV-2 обнаружили французские ученые?

А вот французский вирусолог из Университета Экс-Марсель Этьен Декроли обратил внимание на необычное строение генома SARS-CoV-2. Французские ученые обнаружили, что ген, кодирующий белок-шип, содержит 4 сегмента, которых нет в других коронавирусах, генетически похожих с человеческим

Полагается, что именно эти сегменты наделяют SARS-CoV-2 исключительными качествами. При этом, первые три сегмента были обнаружены и в ранее известных штаммах коронавируса, что, по мнению ученых, подтверждает их давнее происхождение и эволюцию. А вот последний – уникальный, ранее не известная ученым. Не исключено, что появление этого четвертого сегмента – результат лабораторных экспериментов. Ученые полагают, что именно он сыграл ключевую роль в распространении патогена среди людей .

Но в то же время многие специалисты выступают категорически против теории лабораторного происхождения вируса. В частности, микробиолог Кристиан Андерсен вместе с коллегами из Колумбийского, Сиднейского и Тулейского университетов, исследовали геном нового коронавируса и пришли к выводу, что он имеет естественное происхождение. По мнению ученых, в основе синтетического вируса был бы уже известный возбудитель человеческих заболеваний, а молекулярная основа SARS-CoV-2 имеет больше общего с вирусом летучих мышей. Что разрушает теорию «биологического оружия» .

Характеристики и структура SARS-CoV-2

Вирион коронавируса SARS-CoV-2, как и большинство других Coronaviridae имеет шарообразную форму, с нуклеокапсидом и РНК внутри, а снаружи покрытым жировой (липидной) оболочкой. Длина РНК составляет до 30 000 нуклеотидов в последовательности, где также присутствуют нетранслируемые участки длиной 281 и 325 нуклеотида. Из липидной оболочки выступают булавовидные пепломеры гликопротеин S, гемагглютинин-эстераза (НЕ), белки М, Е.

Устойчивость во внешней среде

Согласно исследованиям2 итальянских ученых Filippo Ansaldi, P Morelli и прочих, капсид коронавируса (SARS-CoV), как и вируса группы А (Influenza A virus) повреждается при контакте с этанолом (70%), хлоргексидином (1%), гипохлоритом натрия (0,01%), что препятствует его дальнейшей репликации.

Другие дезинфекторы, которые убивают коронавирус в течение 1 минуты — этанол (80% и более), изопропанол (45%), н-пропанол (30%), мезетрония этилсульфат (0,2%).

Вирус разрушается на поверхности в случае воздействия на него температуры +33 °С в течение 16 часов, или +56 °С, в течение 10 минут.

Также инфекция разрушается при воздействии ультрафиолетовых лучей в течение 2-15 минут, это в случае обработки поверхности УФ-облучением от кварцевых ламп.

В воде коронавирусы способны сохранять свою активность в течение 9 суток. Столько же времени инфекция живет при комнатной температуре (около 22 °С) на следующих поверхностях — пластик, металл, стекло, бумага.

При охлаждении до +4 °С, особенно на фоне высокой влажности или замораживании температурой в −70 °С — в течение нескольких лет.

Путешествие патогенов

Разнообразные патогены, включая бактерии, грибы, вирусы и гельминты являются основными группами паразитов, причем не только позвоночных животных и человека, но и насекомых. Так, внутри крошечных муравьев живут еще более крошечные паразиты, использующие тело насекомого как среду обитания, источник пищи или «временное прибежище» для поиска конечного хозяина.

Но соседство хозяин-патоген иногда приносит страдания, а в некоторых случаях смерть. Так, ланцетовидная двуустка – крошечный паразит, конечным хозяином которого являются парнокопытные, буквально захватывает мозг муравья, заставляя последнего взбираться на вершину листка, где тот остается вплоть до момента, пока его не съест овца или корова. А о том, как грибы-паразиты превращают муравьев в зомби читайте в увлекательной статье моего коллеги Рамиса Ганиева.

Ланцетовидная двуустка собственной персоной

Откуда появился коронавирус

К наиболее опасным для человека коронавирусам относятся:

• SARS-CoV (ТОРС) – тяжелый острый респираторный синдром, который впервые выявлен в 2002 г. в Китае. Природным резервуаром этого коронавируса являются летучие мыши (промежуточным хозяином могут быть мелкие млекопитающие, например, циветты). Случаи заболевания зарегистрированы в 29 странах (8437 случаев), летальность составляет 9,6%.
• MERS-CoV (коронавирус ближневосточного респираторного синдрома) – зоонозное заболевание, природным резервуаром для которого являются летучие мыши, а промежуточным хозяином – одногорбые верблюды. От человека к человеку передается при тесном контакте. Впервые выявлен в 2012 г. на Аравийском полуострове, зарегистрирован в 27 странах мира. Количество больных на 2019 г. составляет около 2500 случаев, летальность – 34,4%.
• SARS-CoV-2 (COVID-19), возбудителем которого стал новый штамм коронавируса. Природным резервуаром этого штамма в настоящее время считают летучих мышей, поскольку его РНК на 90% совпадает с коронавирусом, выявленным у летучих мышей. Промежуточный хозяин в настоящее время неизвестен. Генетическая последовательность нового коронавируса на 79% совпадает с генетической последовательностью вируса SARS-CoV. От человека к человеку передается воздушно-капельным путем, отличается длительным инкубационным периодом (1-14 дней), высокой контагиозностью (один больной может заразить от 2 до 4 человек) и возможностью бессимптомного носительства. Обнаруженный в конце декабря 2019 г. в китайской провинции Ухань COVID-19 быстро распространился по миру несмотря на карантинные меры, и уже 11 марта 2020 г. ВОЗ объявил, что новое заболевание приобрело характер пандемии. Количество больных по странам и смертность от коронавируса показывает статистика в реальном времени.

Этапы жизненного цикла вируса SARS-CoV-2

Для коронавирусов характерен продуктивный тип взаимодействия с клетками-мишенями организма (появляется новое поколение вирионов, инфицированная клетка погибает). Попавший в организм коронавирус последовательно проходит стадии жизненного цикла:

1. Начальный контакт вируса и клетки в результате случайного столкновения и рецепторную адсорбцию, в процессе которой коронавирус прикрепляется к поверхности клетки. Адсорбция состоит из двух фаз – неспецифической и высокоспецифической. Неспецифическая фаза характерна для вирусов разного вида и связана с электростатическим взаимодействием разнозаряженных групп на поверхности вируса (аминные группы с зарядом +) и клетки (карбоксильные, сульфатные и фосфатные группы с зарядом -). Специфическая фаза основана на комплементарности рецепторов клетки и «узнающих» эти рецепторы химических соединений в составе биомолекулы вирусов (лиганды). Специфический клеточный рецептор определяет внутриклеточный транспорт вирусной частицы, ее доставку в цитоплазму или ядро, где вирус может запустить инфекционный процесс (прикрепление вируса к неспецифическим рецепторам возникновение инфекции не вызывает). Узнающие специфический клеточный рецептор белки на поверхности вируса называют прикрепительными белками. Для SARS-CoV-2 клеточным рецептором согласно исследованиям 2020 г. является ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2 или angiotensin-converting enzime АСЕ2), который оказывает расслабляющее влияние на стенки кровеносных сосудов. При точечном взаимодействии вирусного белка с липидами клеточной мембраны происходит слияние липопротеидной оболочки вируса и мембраны клетки.
2. Проникновение нуклеокапсида в цитоплазму клетки-хозяина, где SARS-CoV-2 использует свою РНК в качестве матричной РНК для синтеза двух протяженных полипротеинов pp1a (2000 аминокислотных остатков) и pp1ab (7000 аминокислотных остатков). Эти полипротеины, которые существуют в виде 16 не входящих в состав нуклеокапсида белков, регулируют дальнейшее размножение вируса.
3. Депротеинизация («раздевание») вируса в специализированном участке клетки (в цитоплазме), при которой в результате последовательных реакций удаляются защитные вирусные оболочки и освобождается внутренний компонент – нуклеокапсид.
4. У коронавирусов акт транскрипции для синтеза вирусспецифических белков отсутствует, генетическая информация передается по самой простой формуле: РНК → белок.
5. Трансляция (реализация генетической информации), при которой в рибосомах клетки на матрице мРНК синтезируется вирусспецифический белок. Рибосома узнает мРНК благодаря кэп-структуре на 5′-конце, потом скользит к 3′-концу и достигает инициаторного кодона. С этого кодона начинается трансляция, после чего к растущей полипептидной цепи присоединяются новые аминокислоты. Трансляция прекращается при достижении рибосомой терминирующего кодона в составе мРНК, после чего полипептидная цепь освобождается. Каждая PHК использует для трансляции группу рибосом, которая называются полирибосомой или полисомой (включает от 4 до 20 и более рибосом). К важнейшим неструктурным белкам относится РНК-зависимая РНК-полимераза, синтезирующая на вирионной РНК комплиментарную нить –РНК. Эта комплиментарная нить служит матрицей для синтеза геномных РНК, которые входят в дочерние вирионы.
6. Формирование дочерних вирионов в эндоплазматическом ретикулуме – внутриклеточном органоиде эукариотической клетки (является разветвленной системой из пузырьков, уплощенных полостей и канальцев, которые окружены мембраной).
7. Выход вирионов из инфицированной клетки путем экзоцитоза – клеточного процесса, при котором мембранные внутриклеточные пузырьки сливаются с внешней мембраной клетки и их содержимое выделяется наружу.

Технологии нового поколения

«Основная работа по секвенированию будет осуществляться при помощи технологий секвенирования нового поколения (NGS) компании Illumina — мирового лидера в области расшифровки геномов. Для этих целей российская биотехнологическая компания «Р-Фарм», выступающая официальным представителем Illumina в России, безвозмездно предоставила НИИ гриппа реагенты для полногеномного секвенирования вирусов SARS-CoV-2″, — сказал ТАСС руководитель направления «Генетическая диагностика» группы компаний «Р-Фарм» Андрей Фролов.

Он напомнил, что именно внедрение технологии NGS в мировую практику позволило обеспечить рекордное падение цены прочтения генома — с $2,7 млрд для первой полной расшифровки человеческого генома до менее чем $1 тыс. за геном в настоящее время. Технология NGS является универсальной для всех организмов. В России на сегодня действует целая программа развития генетических технологий в рамках нацпроекта «Наука», стимулирующая развитие генной инженерии в различных отраслях отечественной науки и практики — в микробиологии, медицине, сельском хозяйстве, промышленном производстве микроорганизмов и других.

«Метод полногеномного секвенирования, реагенты для которого переданы в НИИ гриппа, позволяет расшифровать всю последовательность ДНК с точностью 99,99%», — отметил Фролов. Это дает возможность отслеживать совсем незначительные изменения в ДНК, вплоть до точечных мутаций. Относительно человека или растений вирусы мутируют очень быстро, поэтому именно такие небольшие изменения могут быть критичными с точки зрения вирулентности. Кроме того, отслеживание таких последовательностей позволяет построить так называемые филогенетические деревья вирусов, по которым виден путь распространения штамма вируса от конкретного носителя. За счет высокой точности секвенирования можно получать достоверные результаты на относительно меньшем числе образцов. В конечном счете, метод полногеномного секвенирования позволяет решить одну из главных задач современной эпидемиологии — прогнозирование новых вспышек эпидемий и оперативного создания вакцин.

«С НИИ гриппа им. А. А.Смородинцева мы работаем достаточно давно как поставщик и как технологический партнер. Безусловно, мы это работу продолжим в будущем. Если коллегам будет нужна какая-то поддержка с нашей стороны, то она будет оказана», — подчеркнул Фролов.

История одного заболевания

COVID-19 (CoronaVirus Disease-2019) – респираторное заболевание, вызываемое вирусом SARS-CoV-2 из семейства Coronaviridae.

Coronaviridae – это класс генетически разнообразных вирусов, обнаруживаемых в широком спектре промежуточных хозяев, включая птиц и млекопитающих. Многие из них вызывают кишечные и респираторные инфекции у животных и у человека. К этому же семейству относятся вирусы:

• SARS-CoV (возбудитель атипичной вирусной пневмонии, эпидемия которой была в Китае и распространилась на Гонконг и остальную часть мира в начале 2000-х годов)
• MERS-CoV (вирус, обусловивший развитие ОРДС-синдрома в странах Ближнего Востока в 2012-2015 гг.)

Профилактика

Профилактика коронавируса 2019-nCoV (SARS-CoV-2), рекомендованная Всемирной Организацией Здравоохранения (ВОЗ) включает в себя:

• Соблюдение правил личной гигиены – обязательно мыть руки мылом и тщательно обрабатывать спиртовыми или иными дезинфицирующими средствами.
• Немытыми руками не трогайте свои глаза, нос, не касайтесь губ, и тем более рта;
• Избегайте тесного контакта с людьми, у которых присутствуют признаки ОРВИ – кашель, чиханье, лихорадка и прочие.
• Избегайте мест большого скопления людей, массовых мероприятий.
• Чтобы не заразить других людей, при чиханье или кашле прикрывайте рот или нос салфеткой или согнутым в локте местом, после чего руки все-равно не забудьте помыть. Помните, чиханье и кашель являются защитными механизмами организма от инородных веществ, с помощью которых тело как-бы очищается.
• При появлении первых признаков ОРЗ обратитесь к врачу за консультацией, ведь если Вы и подцепили инфекцию, своевременные выявление и терапия минимизирует риск осложнений болезни.
• Мясные продукты и яйца хорошо обрабатывайте термическим способом.
• Откажитесь от употребления в пищу «лакомств» жителей Китая – змей, летучих мышей, псов и т.д.;
• В жилом помещении и на работе не забывайте проводить влажную уборку с применением дезинфицирующих средств, хотя бы 2 раза в неделю.
• Укрепляйте свой организм дополнительным приемом витаминов и макро- микроэлементов (витаминно-минеральные комплексы), особенно в зимне-весенний период.

Все меры профилактики коронавируса от ВОЗ, Минздрава и других медучреждений (список пополняется)

Обратите внимание на то, что использование обычных бумажных масок не гарантирует безопасность от коронавирусных инфекций, поскольку они способны перемещаться в воздухе и проникать в дыхательные пути через щели, между маской и кожей

Вакцинация

Еще в начале 2020 года ученые по всему миру заявляли, что прививка от коронавируса выйдет в мир не ранее весны-лета 2021 года. Однако, повышенный спрос и активное участие в разработке вакцины от COVID-19 многими странами привело к запуску вакцинации населения некоторых стран уже в этом, 2020 года.

По состоянию на конец 2020 года уже получили разрешение на использование следующие виды вакцины от коронавируса SARS-CoV-2:

• Pfizer/BioNTech — совместная разработка двух компаний Pfizer (США) и BioNTech (Германия). Требуется 2х кратное введение вакцины. Согласно разработчикам, эффективность по отношению к SARS-CoV-2 достигает 90%. Относится к новым вакцинам mRNA, основывается на фрагменте генетического кода вирусно инфекции.
• Moderna — разработана американской фармацевтической компанией. Требуется 2х кратное введение вакцины. Согласно разработчикам, эффективность по отношению к SARS-CoV-2 достигает 94%.

Профилактика

Специфическая профилактика COVID-19 (при помощи вакцины)в настоящее время находится в стадии разработки.

К неспецифической профилактике коронавируса относят:

• Изоляцию пациентов в отдельные боксы или палаты в инфекционном стационаре, где проводится уход и лечение. Выписка проводится после двух отрицательных результатов ПЦР-теста.
• Использование медицинских масок (необходимо менять их каждые 2 часа), применение средств индивидуальной защиты для медработников (защитный комбинезон и т.д.), дезинфекцию помещений, утилизацию медицинских отходов, транспортировку больных специальным транспортом.
• Своевременное обращение больных в медучреждения.
• Ограничение контактов на близком расстоянии.
• Соблюдение температурного режима и оптимальной влажности в помещении.
• Увлажнение слизистых оболочек верхних дыхательных путей.
• Регулярное мытье рук.

Также рекомендуется не посещать места большого скопления людей и регионы, где зарегистрированы вспышки заболевания.

Прогноз

Поскольку распространение коронавируса не удалось локализовать и он выявлен практически во всех странах мира, учеными рассматривается три сценария окончания пандемии:

1. Благодаря карантинным мерам все пораженные вирусом страны смогут одновременно остановить распространение заболевания и очаги эпидемии удастся ликвидировать. Учитывая масштабы распространения COVID-19 (интерактивная карта коронавируса) и проблемы с массовым тестированием населения, этот сценарий выглядит маловероятным.
2. Коронавирус пройдет по миру и после эпидемии останется достаточное количество людей с иммунитетом, поэтому в конечном итоге SARS-CoV-2 не сможет найти себе жизнеспособных хозяев (по примеру пандемичного гриппа). Недостатком этого сценария является более высокая заразность коронавируса и более высокая смертность – насколько опасен коронавирус, показывает статистика в реальном времени. Последствием данного сценария будет большое количество жертв и разрушенные системы охраны здоровья.
3. Устранение очагов эпидемии до момента изобретения вакцины от коронавируса и массовая вакцинация. Этот сценарий займет несколько лет, несмотря на рекордные сроки изобретения вариантов вакцин и начала первых клинических испытаний (между определением нуклеотидной последовательности данного коронавируса и началом первых клинических испытаний прошло всего 63 дня). Разработка проверенной вакцины займет по подсчетам ученых от 12 до 18 месяцев, после чего начнется этап изготовления, доставки и введения, что тоже требует времени.

Так как в настоящее время неизвестны сезонность и длительность иммунитета к коронавирусу, прогнозы со временем будут корректироваться.

Клинические особенности

Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Acinetobacter, CandidaТаблица. Сравнение клинических и лабораторных характеристик MERS и SARS

Вставка Потенциально эффективные антивирусные препараты при MERS-CoVНейтрализующие антителаИнтерфероныЛекарства, применяющиеся не по прямому назначениюДругое*Польза от лечения превышает риски† Риск применения лечения, вероятно, превышает пользу.

Чемпионский прыжок

Тем временем очень многие исследования показывают, что новый коронавирус действительно обладает удивительной способностью легко переходить к разным животным. В лабораторных экспериментах было показано, что кошки, египетские летучие собаки (Rousettus aegyptiacus), хорьки, макаки-резус и хомяки чувствительны к SARS-CoV-2. Вне лабораторий этот коронавирус находили также у многих животных, включая домашних кошек и собак, тигров и львов в зоопарках, а также выращенных на фермах норок. Скорее всего, они заражались от людей.

Вероятность проникновения SARS-CoV-2 в организмы разных позвоночных анализировали также с помощью вычислительных моделей. Впрочем, моделирование не всегда коррелирует с экспериментальными данными. Есть примеры, когда моделирование вроде отрицает возможность проникновения в клетку, а лабораторные опыты показывают обратное, — говорится на страницах журнала Nature.

лев

Фото: REUTERS/Yiannis Kourtoglou

Но главный вопрос статьи повис в воздухе: нужно ли все-таки пытаться найти первоначального хозяина SARS-CoV-2 в дикой природе или на данном этапе пандемии, когда вирус мог передаться от человека к животным, это бесполезно?

— Думаю, что люди могли передать коронавирус животным, считает заведующая лабораторией анализа генома Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН Светлана Боринская. — Но это не помешает сделать вывод о его истинном происхождении. По геномам, по накопленным мутациям будет видно, какой вирус от какого произошел. Биоинформатики отлично умеют это делать: построить дерево и посмотреть, какой вирус «моложе», какой «старше». То есть кто от кого его получил.

Также исследователь уверена, что через несколько лет, если Ши Чжэнли (исследователь, опубликовавшая статью о RаtG13) и ее коллеги продолжат свои поисковые работы, накопление данных позволит разобраться в этой истории. Пока ясно лишь то, что первых пациентов нашли в Ухане. Позже станет известно, из какой именно точки (допустим, конкретной деревни) пошла инфекция, где коронавирус перешел из дикой природы к человеку, — добавила Светлана Боринская.

Её оптимизм поддерживает и pyководитeль Научно-образовательного центра геномных исследований СФУ, профессор Гёттингенского университета (Германия) Константин Крутовский.

— Действительно, биоинформатикам под силу такая задача, — сообщил «Известиям» эксперт. — Именно так и будет. Однако если представить себе, что существует необходимость запутать ученых, это тоже можно будет сделать довольно просто. Для этого нужно взять старый образец коронавируса из лабораторной коллекции, который являлся исходным штаммом SARS-CoV-2, и распространить его среди потенциальных хозяев. А потом там же выделить этот вирус обратно и предъявить миру.

Впрочем, по мнению Константина Крутовского, такой поворот событий — чисто гипотетический.