Рзн 2020/11808

Взятие пробы для ПЦР

Показано, что для выявления нового коронавируса подходят смывы из носоглотки —  из ротоглотки вероятность ложноотрицательного анализа немного выше []. Один из важнейших аспектов —  время взятия материала. Проведенные исследования показывают, что при взятии материала у больного в первый день проявления симптомов COVID-19 положительный диагноз поставят с вероятностью 94 %, а вот к 10-му дню это будет всего лишь 67 %! [

Существует четкая закономерность: чем позже от возникновения симптомов взят материал, тем меньше шансов обнаружить в нем вирусную РНК.

Есть и хорошие новости: в течение первой недели от возникновения симптомов носоглоточные смывы имеют порядок от 105 до 106 копий вирусной РНК в 1 мл, что делает их легко обнаруживаемыми даже не самыми чувствительными системами. Исследования также показали, что вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях может быть одинаковой у людей с проявленной симптоматикой и при бессимптомном течении болезни

Теория 1. Во всем виноваты летучие мыши

SARS-CoV-2 – это уже третий коронавирус, вызвавший эпидемию за последние 20 лет. Первым был в 2002-м SARS-CoV, вторым – MERS-CoV, который дал начало массовой заболеваемости в 2012 году. Но возбудитель COVID-19, несмотря на общие черты с ранее известными коронавирусами, вызывает у специалистов немало вопросов, на которые пока нет однозначных ответов.

Когда стало известно о вспышке заболевания в Ухани, виновниками COVID-19 сразу назвали летучих мышей. Дело в том, что данное семейство коронавирусов в основном циркулирует среди этих животных. Известно, что почти 500 видов летучих мышей переносят коронавирусы. При этом одно и то же животное может быть инфицировано одновременно несколькими штаммами вируса, что только способствует рекомбинации и эволюции вируса. В последствии таких изменений у штаммов появляется способность преодолевать видовые барьеры.

Что касается SARS-CoV-2, то геном этого вируса на 96% идентичен вирусу, найденному в гуано летучих мышей в 2013 году (RaTG13). А вот со своим «предшественником» SARS-CoV-1 последний коронавирус похож только на 79%, а с MERS-CoV еще меньше – на 50%. То есть новый коронавирус генетически имеет намного больше общего со штаммом, ранее циркулирующим только среди летучих мышей, и намного меньше – со штаммами, ранее уже поражающими людей. Кроме того, факт, что в 99,98% случаев образцы нового коронавируса у инфицированных пациентов идентичны, служит для ученых основанием утверждать, что среди человеческой популяции SARS-CoV-2 циркулирует недавно .
Китайские ученые сопоставили 5 геномов SARS-CoV-2 и 276 геномов коронавирусов, поражающих ранее людей и животных. Исследователи обнаружили, что новые вирусы появились от общего предка примерно в 2018 году из-за рекомбинации коронавируса летучих мышей и, вероятно, китайских змей . Тем не менее, группа ученых оспорила теорию своих китайских коллег, будто змеи могут инфицироваться и быть носителем нового вируса .

Казалось бы, в версии с летучими мышами все просто, но есть в этой истории недостающее звено, из-за которого возникает много вопросов. Раньше не было известно ни одного случая прямого инфицирования от летучих мышей людей. В ходе вирусной мутации должен был быть так называемый промежуточный хозяин, в организме которого вирус мутировал до формы, способной поражать человека. По крайней мере, именно по такому сценарию происходила мутация двух предыдущих коронавирусов.

В случае с возбудителем COVID-19 ни одного подтвержденного животного-посредника не было обнаружено. По одной из версий, связующим звеном могли быть панголины. Но эта гипотеза также вызывает больше вопросов, чем предоставляет ответов.

Проще говоря, между RaTG13 вирусом, диагностированным у летучих мышей, и SARS-CoV-2, должен быть еще один – посредник . Но пока такого не обнаружили. И пока не будет найден посредник, теория о том, что пандемия COVID-19 – результат утечки вируса из лаборатории, также имеет право на существование.