Рнк вируса гепатита с не обнаружено

От ВИЧ до ковида

— Андрей Михайлович, по степени подлости, изощренности воздействия есть аналогичные SARS-CoV-2 вирусы?

— Будет корректным сказать, что возбудители многих вирусных инфекций отличаются своеобразным «коварством». В отношении ВИЧ-инфекции очень долго проводились изучение особенностей иммунопатогенеза и разработка методов лабораторной диагностики. Был даже период в лабораторной диагностике, когда мы допускали существование так называемого «серологического окна», то есть периода от момента вероятного инфицирования и получения положительного результата в методах лабораторного анализа, до 3-4 месяцев. Но это крайняя степень, потому что вирус четко избирателен и направлен на клетки иммунной системы. Здесь возможен промежуточный вариант. Очень важным представляются уяснение механизмов формирования индивидуальной чувствительности к вирусу и их влияние как на клинические проявления, так и на результаты лабораторного обследования.

— Что сложнее для исследования — вирусы, бактерии?

— Конечно, чем труднее выделить и культивировать в лабораторных условиях микроорганизм, тем сложнее его изучение. Если говорить о возбудителях грибковых, бактериальных и протозойных инфекций, то они более доступны для исследования. В отношении возбудителей вирусной природы возникают объективные сложности.

SARS-CoV-2 обладает нетривиальными способностями и свойствами. Что значит нетривиальными? Вызывает широкий спектр клинических проявлений. Передается аэрозольным механизмом передачи, при этом реализуется воздушно-капельный, воздушно-ядрышковый и воздушно-пылевой пути. Одновременно существует контактно-бытовой путь инфицирования. Не исключается и фекально-оральный механизм передачи. И эти обстоятельства требуют очень интенсивных и широких научных исследований.

— Он может оставаться и быть источником заражения на предметах?

— Степень устойчивости SARS-CoV-2 дискутируется в научных и медицинских кругах. Существуют диаметрально противоположные точки зрения — от утверждения о возможности сохранять вирусом жизнеспособность после воздействия температуры 95 градусов до мнения, что вирус погибает во внешней среде через несколько минут. Немецкие исследователи проводили изучение внешних объектов и обнаруживали РНК вируса, но на культурах клеток не обнаруживали его размножения, то есть сделали вывод, что у него нет жизнеспособности. Но культура клеток — это не полный аналог внутренней среде организма человека. То есть вирус просто может не иметь должных условий для размножения в искусственных условиях. Тем не менее эпидемиологически показано, что наибольший риск инфицирования возникает только при относительно длительном непосредственном контакте с больным человеком. И это может косвенно говорить о неспособности вируса сохранять жизнеспособность и инфекционную опасность при его нахождении на объектах внешней среды.

Диагностика заболевания

Принципы проведения качественного анализа на ВГC

Принципы проведения качественного анализа на ВГC

История изучения

«Я уверен, что они не могли повторно заразиться»

Фото: AP Photo/Mark Schiefelbein

В Китае в последние недели склонны рассматривать «повторно заразившихся» пациентов как «долгосрочно положительных». Это не то же самое, что быть носителем хронической инфекции.

Как правило, долго болеют пожилые люди со слабой иммунной системой и сопутствующими хроническими заболеваниями, сообщил 29 апреля китайскому изданию Global Times директор Института вирусологии Уханьского университета Ян Чжаньцю.

Период разрушения коронавируса у таких пациентов может достигать 60 дней. При этом симптомы респираторного заболевания у них могут отсутствовать, поскольку концентрация вируса в организме очень низкая.

SARS-CoV-2 выявляется повторно даже спустя 70 дней после первой постановки диагноза, сообщил агентству Reuters руководитель одной из больниц в Ухане. Растущее число случаев, когда люди вроде бы выздоравливают, а потом их анализы снова оказываются «положительными» – одна из самых больших проблем для врачей города, где коронавирус впервые был обнаружен в декабре прошлого года, пишет агентство.

Профессор Пол Хантер из Университета Восточной Англии, комментируя выводы китайских медиков, сообщил Reuters, что аналогичное медленное течение коровирусной инфекции или гриппа встречается иногда у пациентов с ослабленным иммунитетом. 

Российские специалисты согласны с тем, что SARS-CoV-2 остается с человеком надолго. «Могу сразу сказать, что очень долго вирус покидает организм. Это правда. И когда человек чувствует себя уже здоровым, он все равно может быть выделителем этого самого вируса», – подчеркнула глава Роспотребнадзора Анна Попова в интервью «России-24».

Может ли оказаться, что люди действительно «подхватывают» коронавирус сразу же после выздоровления?

Врач скорой помощи одной из уханьских больниц Чжао Янь считает, что это невозможно. Пациенты, которых он знает, сначала находились в больнице под пристальным наблюдением, а потом соблюдали карантин. «Я уверен, что они не могли повторно заразиться», – приводит его слова Reuters.

К сожалению, у научного сообщества такой уверенности нет.

Справка
Развитие иммунитета к патогену (микроорганизму, вызывающему болезнь) – это многоступенчатый процесс. Сначала вирусная инфекция приводит к неспецифической врожденной реакции организма, поясняется в документе, опубликованном на сайте ВОЗ.
На этой стадии распространению вируса препятствуют клетки иммунной системы (макрофаги, нейтрофилы и т.п.), призванные поглощать чужеродные частицы. Одновременно вырабатываются интерфероны (белки, подавляющие размножение вируса) и другие вещества, которые защищают организм от любого возбудителя.
Позднее начинается специфическая реакция, когда вырабатываются антитела, направленные против конкретного патогена, в данном случае против SARS-CoV-2. Обычно степень защищенности организма от повторного заражения измеряется количеством именно этих, нейтрализующих вирус антител в крови.

Живые и мертвые

Подагра и разум: слово о вреде полезного

В нашем представлении степень разумности определяется способностью человека различать приносящее пользу и вред, а так же способностью следовать по пути пользы. Действительно, трудно назвать разумным того, кто наносит ущерб самому себе.

Разумеется, все мы вроде бы желаем себе одной лишь только пользы и всегда выбираем то, что представляется наилучшим. Однако «разбитые корыта» в конце пути — частенько намекают нам на ошибочность наших выборов. Но это происходит уже после того, как ущерб от прошлого выбора становится очевидным.

«Благими намерениями устлан путь в ад» — говорили об этом древние, указывая на то, что не всё кажущееся полезным таковым является.

Дело в том, что совершая выбор, мы делаем его на основе имеющихся у нас знаний и представлений. А где гарантия, что они у нас истинные? Будь так — мы бы все жили в мире, богатстве и здравии. Но действительность демонстрирует нам нечто совсем другое. Это доказывает, что сложившиеся у нас мировоззрения не являются верными. Ведь если мировоззрение – это имеющаяся у нас модель мироздания, то обладай мы совершенным мировоззрением, то есть точным знанием об устройстве себя и окружающего мира – мы бы никогда не ошибались. Мы бы всегда действовали безупречно. А сегодня понятие безупречности напрочь отсутствует в быту и больше относится к кастанедовским магическим практикам, нежели к нашей жизни.

И действительно: точно зная о том, что будет, если наступить на хвост кобры или торчащий гвоздь – человек никогда не сделает этого сознательно. Однако если сравнить подагру с укусом змеи, то само её появление доказывает, что на какой-то «хвост» мы всё-таки наступили. И совершенно ясно, что знай мы о последствиях шага на этот «хвост» – мы бы туда и не сунулись.

Какое отношение вся эта философия имеет к подагре, спросите вы? Самое прямое.

Подагра есть нарушение обмена веществ, происходящее, в большинстве случаев, в результате избытка входящей в организм кислоты. Не будь на входе в организм избытка пуринов – не было бы и подагры. Пурины попадают в организм лишь вместе с пищей. Следовательно, правильный режим и состав питания не допустят в организм избыточных пуринов и просто не позволят сложится условиям для возникновения подагры. Запомним этот вывод и рассмотрим роль Колхицина в лечении подагры.

Антитела: много неясного

Репликация

Что такое дезоксирибонуклеиновая кислота?

Виды анализов и их отличия

Что это значит?

Функции РНК

Что показывает анализ?

РНК вируса гепатита С не обнаружено

Для первичной диагностики гепатита С используются данные, полученные в процессе качественного анализа. Этот диагностический метод относится к наиболее точным и в настоящее время считается одним из лучших способов определения наличия в крови пациента возбудителя вирусного воспаления печени. Результаты анализа могут быть следующими:

• РНК гепатита С не обнаружено. Что это значит? Это означает, что фрагментов патогенной рибонуклеиновой кислоты в исследуемом образце крови нет. Такой результат может говорить о том, что обследуемый здоров.
• РНК гепатовируса обнаружено. Такой результат может говорить о наличии патогена в организме человека. Но болезнь не обязательно находится в активной форме (возможно, что вы являетесь носителем вируса или на данный момент инкубационный период).

Таким образом, если РНК не обнаружено, гепатита С в организме обследуемого, скорее всего, нет. Однако рекомендуется пройти дополнительную диагностику, так как возможны и ложные результаты.

Разновидности тестирования и расшифровка результатов

Коронавирусы возвращаются

Фото: Михаил Метцель/ТАСС

Вирусы в принципе могут «возвращаться» к переболевшим людям, вопрос лишь в том, как скоро это произойдет, и насколько тяжело будет протекать болезнь в следующий раз.

«Повторное заражение некоторыми вирусами возможно лет через 5-10 после первого случая, когда иммунитет угасает. И оно всегда протекает в более легкой форме, чем исходное», – отметил в интервью  «Милосердию.ru» Александр Лукашев, вирусолог, директор Института медицинской паразитологии, тропических и трансмиссивных заболеваний им. Е.И.Марциновского.

С тем, что во второй раз COVID-19 должен переноситься легче, согласен специалист по инфекционным заболеваниям из Университета Сиднея (Австралия) Адам Камрадт-Скотт.

Даже в течение одного года после первой постановки диагноза повторное заражение коронавирусом – не редкость, заявили ученые из Колумбийского университета (США) Марта Галанти и Джеффри Шэман.

Они изучили четыре вида коронавирусов и поделились результатами исследования на сайте MedRxiv. Иммунитет к таким патогенам недолговечен, резюмировали они. Причем тяжесть повторного заболевания зависит от особенностей врожденного иммунитета человека, а не от количества антител, образовавшихся в организме после первой встречи с инфекцией.

Умеренный оптимизм выразил один из ведущих американских иммунологов и инфекционистов Энтони Фаучи, которого цитирует The Hill. По его словам, люди, переболевшие COVID-19 в феврале-марте этого года, будут защищены от повторного заражения, по крайней мере, в сентябре-октябре.

Особенности анализа

Вирусный гепатит С относится к типу заболеваний с осложненной диагностикой. Проблема в том, что в большинстве случаев заболевание проявляется бессистемно, ярких симптомов не наблюдается, и пациент может попросту не подозревать о своем недуге. Таким образом, помочь определить заболевание на ранних стадиях и выявить РНК вируса гепатита С можно только на основании качественного анализа крови.

Обследование основывается на полимеразной цепной реакции (ПЦР). Суть его заключается в эксплуатации специфических ферментов, имитирующих РНК ВГС. В процессе исследования изучается реакция образцов крови пациента на эти ферменты. Это позволяет выявить наличие и концентрацию патогена.

Преимуществами анализа на выявление элементов вирусного РНК являются:

Однако некоторые нюансы необходимо принимать в расчет. В первую очередь, пациенту рекомендуется обращаться только в те медицинские учреждения, в штате которых трудятся специалисты высокого уровня. Из-за чувствительности реагентов малейшая неточность в работе лаборанта приводит к ложноположительным или ложноотрицательным результатам.

Также необходимо понимать, что у каждого аппаратного оборудования есть нижний предел чувствительности к реагентам. Это означает, что если возбудитель вирусного воспаления печени пребывает в крови больного в чрезвычайно низкой концентрации, даже такой точный метод, как ПЦР, может не выявить его РНК. Если у пациента или лечащего врача сохраняется подозрение на заражение ВГС, рекомендуется через некоторое время пройти повторную диагностику.

Примечания

Достоинства и недостатки метода ПЦР

Современные методы позволяют точно подобрать набор веществ, нужных для реакции, а значит, «достроить» именно ДНК SARS-Cov-2, а не другого похожего.

Теперь о недостатках. Первое — относительно высокая цена. Она обусловлена высокой себестоимостью как праймеров, так и оборудования – амплификаторов. Второе — время. Ждать, пока размножится ДНК, нужно несколько часов, а с учетом транспортировки до лаборатории результаты теста пациент может узнать через сутки и более.

Также эффективность теста не превышает 80%. Праймеры для реакции подбираются на основе информации об РНК вируса. Но фрагмент с теми же «буквами» может оказаться и в других микроорганизмах пробы – отсюда ложноположительный результат. Ложноотрицательный результат получится, если вирусные частицы ушли из ротоглотки, спустились дальше по дыхательному пути. Тогда в пробе просто не окажется РНК вируса.

Сдавать тест ПЦР есть смысл в том случае, если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом.

Тромбы повсюду…

Мы выяснили, что коронавирус повреждает не только легкие, но и эндотелий сосудов, т.к. в нем есть рецепторы, с которыми он соединяется.

Любое повреждение сосудов – сигнал для системы свертывания крови активизироваться, чтобы «залатать» эти повреждения и не допустить кровотечения.

К местам повреждений срочно сбегаются тромбоциты и встают «плечом к плечу», т.е. склеиваются. Говоря медицинским языком, происходит агрегация тромбоцитов.

Поскольку при Covid-19 повреждения сосудов множественные, то и тромбов образуется множество. Сосудистую стенку они «залатали», но при этом заблокировали кровоток, а значит, нарушили питание органа, к которому по этому сосуду доставляется все необходимое для его нормального функционирования.

В итоге – «смерть» части органа (инфаркт или инсульт) и высокая вероятность смерти больного.

Вот почему при тяжелом течении коронавирусной инфекции или при наличии факторов риска обязательно назначаются антикоагулянты или антиагреганты.

Этим же объясняется и более высокая заболеваемость и смертность у больных с сердечно-сосудистыми заболеваниями или сахарным диабетом. У них уже имеются повреждения сосудов, кровоток и так нарушен тромбами или холестериновыми бляшками, а коронавирус только усиливает эти нарушения.

Ответы на частые вопросы

Лечение все равно проводится при сомнительных результатах тестирования?

Врачи имеют право выставить диагноз «коронавирусная инфекция» по клинической картине, не дожидаясь лабораторного подтверждения. Назначая медикаменты, они ориентируются на данные флюорографии или КТ.

Бывает ли недостоверным тест при неправильном взятии мазка?

На правильность результата оказывает влияние техника взятия соскоба из дыхательных путей. Медик должен захватить часть клеток с задней стенки глотки, но если зонд повернуть неправильно, то и результат лабораторного исследования будет неверным.

Чувствительность тестов и частота их проведения

Что такое рибонуклеиновая кислота?

РНК — это нуклеиновая кислота с мономерами, называющимися рибонуклеотидами.

По химическим свойствам она очень похожа на ДНК, так как обе являются полимерами нуклеотидов, представляющих собой фосфолированный N-гликозид, который выстроен на остатке пентозы (пятиуглеродного сахара), с фосфатной группой пятого углеродного атома и основания азота при первом углеродном атоме.

Она представляет собой одну полинуклеотидную цепочку (кроме вирусов), которая намного короче, чем у ДНК.

Один мономер РНК — это остатки следующих веществ:

• основания азота;
• пятиуглеродного моносахарида;
• кислоты фосфора.

РНК имеют пиримидиновые (урацил и цитозин) и пуриновые (аденин, гуанин) основания. Рибоза является моносахаридом нуклеотида РНК.

Альтернатива ПЦР-диагностике

В любом случае нужно повышать чувствительность тест-систем на основе ПЦР, заключает Алексей Чемерис, а для этого нужны другие подходы. «Надо сделать так, чтобы ложнонегативных результатов было меньше, практически исключить их», — считает он.

В обзоре, подготовленном вместе с коллегами, профессор Чемерис рассматривает преимущества и недостатки ПЦР-диагностики и других методов амплификации — копировании РНК бетакоронавирусов, к которым относится SARS-CoV-2. Теоретически весьма перспективен метод петлевой амплификации — LAMP, где используют сразу шесть или восемь праймеров.

«С одной стороны, повышается специфичность: только когда все праймеры отожгутся (сработают, распознав РНК коронавируса. — Прим. ред.), начнется амплификация, с другой — вирус мутирует и шансы, что реакция не пойдет, увеличиваются, поскольку какие бы участки генома ни выбрать, все равно вероятность мутаций больше в восьми участках, чем в двух или трех (при использовании гибридизационного зонда), достаточных для ПЦР», — объясняет исследователь.

Во время предшествующей эпидемии SARS возбудителя выявляли с помощью реакции NASBA (амплификации на основе секвенирования нуклеиновых кислот) и RCA (репликации по типу катящегося кольца). Геномный редактор CRISPR-Cas также пробуют применять для идентификации РНК нового коронавируса. Есть работы по полногеномному секвенированию любого генетического материала, находящегося в биоматериале. Метод очень чувствительный, но дорогой и долгий — занимает 20 часов. Так что в ближайшее время ПЦР с обратной транскрипцией останется самым массовым способом обнаружения коронавируса в организме.

Транспортная рибонуклеиновая кислота

Транскрипция

Синтез всех молекул происходит во время транскрипции, то есть переписывании генетической информации с определенного оперона ДНК. Процесс в некоторых моментах похож на репликацию, а в других существенно отличается от нее.

Сходствами являются следующие части:

• начало идет с деспирализации ДНК;
• происходит разрыв водородных связей между основаниями цепей;
• к ним комплементарно подстраиваются НТФ;
• происходит образование водородных связей.

Отличия от репликации:

• при транскрипции расплетается лишь участок ДНК, соответствующий транскриптону, в то время как при репликации расплетению подвергается вся молекула;
• при транскрипции подстраивающиеся НТФ содержат рибозу, и вместо тимина урацил;
• информация списывается лишь с определенного участка;
• после образования молекулы водородные связи и синтезированная цепь разрываются, а цепь соскальзывает с ДНК.

Для нормального функционирования первичная структура РНК должна состоять только из списанных с экзонов ДНК-участков.

У только что образованных РНК начинается процесс созревания. Молчащие участки вырезаются, а информативные сшиваются, образуя полинуклеотидную цепь. Далее, каждый вид имеет присущие только ему превращения.

В и-РНК происходит присоединение к начальному концу. К конечному участку присоединяется полиаденилат.

В т-РНК модифицируются основания, образуя минорные виды.

У р-РНК также метилируются отдельные основания.

Защищают от разрушения и улучшают транспортировку в цитоплазму белки. РНК в зрелом состоянии с ними соединяются.

Рибосомальная рибонуклеиновая кислота

Норма количественного исследования РНК вируса гепатита С

ОТСУТСТВИЕ ДЕЙСТВУЮЩЕГО ЗОЛОТОГО СТАНДАРТА

Более того, стоит упомянуть, что тесты ПЦР, используемые для выявления так называемых пациентов с COVID-19, предположительно инфицированных так называемым SARS-CoV-2, не имеют действующего золотого стандарта для их сравнения.

Это принципиальный момент. Тесты необходимо оценивать, чтобы определить их точность, строго говоря, их «чувствительность» и «специфичность» — путем сравнения с «золотым стандартом», то есть наиболее точным из доступных методов.

Если бы у нас был новый тест на обнаружение золотистого стафилококка в крови, у нас уже были посевы крови на питательных средах, это наш золотой стандарт, который мы использовали в течение десятилетий, и мы могли бы сопоставить этот новый тест с этим. Но для COVID-19 у нас нет золотого стандарта.

Но вместо того, чтобы классифицировать тесты как непригодные для обнаружения SARS-CoV-2 и диагностики COVID-19 или вместо того, чтобы указывать на то, что только вирус, подтвержденный путем выделения и очистки (изоляция вируса), может быть твердым золотым стандартом, ВОЗ со всей серьезностью заявляет, сам анализ ПЦР, «может быть лучшим доступным «золотым стандартом »».  Но это не научно обосновано.

Расшифровка анализа на определение РНК гепатита С

Информационная рибонуклеиновая кислота

Заключение